RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	NLRP14	Q86W24	1093 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM72B	Q86X60	149 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338		J3QKU1	62 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	KRIT1	O00522	736 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	AREL1	O15033	823 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	TSPAN6	O43657	245 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	ITIH2	P19823	946 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP11A	P98196	1134 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	VAC14	Q08AM6	782 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	SGCG	Q13326	291 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	NR0B2	Q15466	257 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	CDO1	Q16878	200 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	NAA35	Q5VZE5	725 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	VPS36	Q86VN1	386 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	NETO2	Q8NC67	525 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	CENPT	Q96BT3	561 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	WBP1	Q96G27	269 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	IL12RB2	Q99665	862 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	DPH1	Q9BZG8	443 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	CLPB	Q9H078	707 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	NDST4	Q9H3R1	872 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAI1	Q9UI46	699 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	LMO7DN	F2Z398	122 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	NEMP1	O14524	444 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	TPP1	O14773	563 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	GJB6	O95452	261 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	GSR	P00390	522 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	MME	P08473	750 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	TSHR	P16473	764 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	BPIFB4	P59827	614 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	CLN3	Q13286	438 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	TCEA2	Q15560	299 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	PLPP6	Q8IY26	295 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	ASB12	Q8WXK4	309 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	COL26A1	Q96A83	441 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB7B	Q96AH8	199 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	SPAST	Q9UBP0	616 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338		F8VZ95	297 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338		K7ENP7	123 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	MMP20	O60882	483 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	TCEA3	O75764	348 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	LRIG2	O94898	1065 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-233	ENST00000602338	RHOQ	P17081	205 aa		12.1	□□□□□ -0.47

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms