RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586262.5

TXNL1-204, Transcript of thioredoxin like 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TXNL1, Length 3,541 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNL1-204ENST00000586262 SNX10Q9Y5X0 201 aa6.9□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa6.9□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 A0A096LPK6 155 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 A0A1B0GTL3 188 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 MYADML2A6NDP7 307 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 ANKRD28O15084 1053 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 TRIM13O60858 407 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 MATN4O95460 622 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 BMP2P12643 396 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 RPL14P50914 215 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 LIMK1P53667 647 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 FAM189BP81408 668 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 SEMA3AQ14563 771 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 PSMD5Q16401 504 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 ANO4Q32M45 955 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 COQ5Q5HYK3 327 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 KANK2Q63ZY3 851 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 C17orf99Q6UX52 265 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 SPRED1Q7Z699 444 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 ISCA2Q86U28 154 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 RETREG3Q86VR2 466 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 KCNMB4Q86W47 210 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 GPATCH11Q8N954 259 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 C3orf30Q96M34 536 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 ZNF560Q96MR9 790 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 OSMRQ99650 979 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 POPDC3Q9HBV1 291 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 CHST12Q9NRB3 414 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 TMEM45AQ9NWC5 275 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 H0Y3Z8 333 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 S1PR4O95977 384 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 HLA-DQB2P05538 268 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 CYP2C18P33260 490 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 USP46P62068 366 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 ITGA9Q13797 1035 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 PPP2R5DQ14738 602 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 SPATS1Q496A3 300 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 LGSNQ5TDP6 509 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 CES3Q6UWW8 571 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 KIAA0408Q6ZU52 694 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 RIMKLAQ8IXN7 391 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 KLHDC9Q8NEP7 349 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 APPL2Q8NEU8 664 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 ATOH8Q96SQ7 321 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 PKP2Q99959 881 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 THTPAQ9BU02 230 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 ANKRD60Q9BZ19 345 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 ULBP1Q9BZM6 244 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 PHF24Q9UPV7 400 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 MTSS1O43312 755 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 TIMM44O43615 452 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 ADAMTS4O75173 837 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 CRTAMO95727 393 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 CD160O95971 181 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 APOA4P06727 396 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 CR2P20023 1033 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 GRIA4P48058 902 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 CLCNKBP51801 687 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 CDKN2DP55273 166 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 RASSF3Q86WH2 238 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 PDPRQ8NCN5 879 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 PTERQ96BW5 349 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 CMTM5Q96DZ9 223 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 FEM1CQ96JP0 617 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 TMEM209Q96SK2 561 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 C19orf43Q9BQ61 176 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 FERMT1Q9BQL6 677 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 TCHPQ9BT92 498 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 APOL6Q9BWW8 343 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 KLHL4Q9C0H6 718 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 SP110Q9HB58 689 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 TMEM248Q9NWD8 314 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa6.89□□□□□ -1.31
TXNL1-204ENST00000586262 CACNG4Q9UBN1 327 aa6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms