RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 KLHL11Q9NVR0 708 aa23.05■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 UCKL1Q9NWZ5 548 aa23.05■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 AP4E1Q9UPM8 1137 aa23.05■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 A0A1W2PQC6 194 aa23.04■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 IGLON5A6NGN9 336 aa23.04■■□□□ 1.28
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PPP4C-212ENST00000567828 NEMP1O14524 444 aa23.04■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
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PPP4C-212ENST00000567828 RHOAP61586 193 aa23.04■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 CAMK2BQ13554 666 aa23.04■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 IQCB1Q15051 598 aa23.04■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 PARP15Q460N3 678 aa23.04■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa23.04■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 SLC25A45Q8N413 288 aa23.04■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 RAB7BQ96AH8 199 aa23.04■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 FUCA2Q9BTY2 467 aa23.04■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa23.04■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 TRIM7Q9C029 511 aa23.04■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 TTYH3Q9C0H2 523 aa23.04■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa23.04■■□□□ 1.28
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PPP4C-212ENST00000567828 SIGLEC6O43699 453 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 IGSF6O95976 241 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 C1SP09871 688 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 CA9Q16790 459 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF542PQ5EBM4 170 aa23.03■■□□□ 1.28
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PPP4C-212ENST00000567828 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 EXOC2Q96KP1 924 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 PEBP4Q96S96 227 aa23.03■■□□□ 1.28
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PPP4C-212ENST00000567828 PCSK1NQ9UHG2 260 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 URB1O60287 2271 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP23.02■■□□□ 1.281e-8■■■□□ 15.8
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PPP4C-212ENST00000567828 PRKCIP41743 596 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 KLHL30Q0D2K2 578 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 SGCGQ13326 291 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 PROX2Q3B8N5 592 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 KDM7AQ6ZMT4 941 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 FAM174AQ8TBP5 190 aa23.02■■□□□ 1.28
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PPP4C-212ENST00000567828 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 GPR27Q9NS67 375 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP4C-212ENST00000567828 DNAJC28Q9NX36 388 aa23.02■■□□□ 1.28
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PPP4C-212ENST00000567828 SERPINC1P01008 464 aa23.01■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 SKILP12757 684 aa23.01■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 HTR7P34969 479 aa23.01■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 HNF1BP35680 557 aa23.01■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 RAD51Q06609 339 aa23.01■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 CYP4F3Q08477 520 aa23.01■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 CYTH1Q15438 398 aa23.01■■□□□ 1.27
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PPP4C-212ENST00000567828 ZSCAN30Q86W11 494 aa23.01■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 OR4C6Q8NH72 309 aa23.01■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF653Q96CK0 615 aa23.01■■□□□ 1.27
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PPP4C-212ENST00000567828 J3KR12 359 aa23■■□□□ 1.27
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PPP4C-212ENST00000567828 AREL1O15033 823 aa23■■□□□ 1.27
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PPP4C-212ENST00000567828 ITIH2P19823 946 aa23■■□□□ 1.27
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PPP4C-212ENST00000567828 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
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PPP4C-212ENST00000567828 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 ARHGEF26Q96DR7 871 aa23■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 IFT43Q96FT9 208 aa23■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PPP4C-212ENST00000567828 PDFQ9HBH1 243 aa23■■□□□ 1.27
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