RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 GEN1Q17RS7 908 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 LRIG3Q6UXM1 1119 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 ECT2Q9H8V3 914 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 SYBUQ9NX95 663 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 SCNN1BP51168 640 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 TTC8Q8TAM2 541 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 ATP2A3Q93084 1043 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 H3BQF6 201 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 PIAS1O75925 651 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 DGKKQ5KSL6 1271 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 RETSATQ6NUM9 610 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 PALM2Q8IXS6 379 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 DNAAF3Q8N9W5 541 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 SH3GL2Q99962 352 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC2A11Q9BYW1 496 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 VPS37BQ9H9H4 285 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 MYO10Q9HD67 2058 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 NFATC1O95644 943 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 ADH1CP00326 375 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 PFKPQ01813 784 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 CEP85LQ5SZL2 805 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 BBS5Q8N3I7 341 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 SORCS1Q8WY21 1168 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 ARL8AQ96BM9 186 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 LRRC39Q96DD0 335 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 CFAP36Q96G28 342 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 TTC25Q96NG3 672 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 VPS45Q9NRW7 570 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 GTSE1Q9NYZ3 720 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 GOLGA6CA6NDK9 693 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 INSIG1O15503 277 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 TULP3O75386 442 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 ABHD2P08910 425 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 GOLGA6DP0CG33 693 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 NR1H3Q13133 447 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 UNC5AQ6ZN44 842 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC25A41Q8N5S1 370 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 NUDCD1Q96RS6 583 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 TRPV5Q9NQA5 729 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 RABGEF1Q9UJ41 708 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 SRFP11831 508 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 SRCP12931 536 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 CDH17Q12864 832 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 MBLAC2Q68D91 279 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 CES3Q6UWW8 571 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 LINC00523Q86TU6 105 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 ATP11CQ8NB49 1132 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 TTC17Q96AE7 1141 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 VOPP1Q96AW1 172 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 CHFRQ96EP1 664 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 ARNT2Q9HBZ2 717 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 SCUBE2Q9NQ36 999 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 ATP9BO43861 1147 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 CPP00450 1065 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 C1QAP02745 245 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 NPY2RP49146 381 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 DGKGP49619 791 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 RHOAP61586 193 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC20A2Q08357 652 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 NCEH1Q6PIU2 408 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 SFTPA1Q8IWL2 248 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 CPA6Q8N4T0 437 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 FBF1Q8TES7 1133 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 DNASE1L2Q92874 299 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 FSD1LQ9BXM9 530 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 TM6SF2Q9BZW4 377 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 TNKS2Q9H2K2 1166 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 DUSP12Q9UNI6 340 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 HS3ST2Q9Y278 367 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 TRIOO75962 3097 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 MUC3AQ02505 3323 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 PRLP01236 227 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 SERPINF2P08697 491 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-209ENST00000532457 GCAP28676 217 aa22.18■■□□□ 1.14
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