RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516223.1

RNU6-1281P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1281, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1281P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ZNF114Q8NC26 417 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 RUBCNQ92622 972 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 RNFT2Q96EX2 444 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ADGRG7Q96K78 797 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 PKP4Q99569 1192 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 CHODLQ9H9P2 273 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 DOCK7Q96N67 2140 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 TIMM23O14925 209 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 LINC01565O15544 149 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ADAP00813 363 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 FMO4P31512 558 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 TTKP33981 857 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 HNF1BP35680 557 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ACTR2P61160 394 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 CYP4A11Q02928 519 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 MYBPHQ13203 477 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 SNTA1Q13424 505 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 CCDC174Q6PII3 467 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 NEK10Q6ZWH5 1172 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 AADATQ8N5Z0 425 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 VPS37AQ8NEZ2 397 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 RASSF8Q8NHQ8 419 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 TMEM170AQ8WVE7 144 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 RNF183Q96D59 192 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 CNPY2Q9Y2B0 182 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 DERAQ9Y315 318 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 STX16O14662 325 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 BUB3O43684 328 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 VNN2O95498 520 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 CH25HO95992 272 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 PLGP00747 810 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 F7P08709 466 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 RPL3P39023 403 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ARSFP54793 590 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 DLG1Q12959 904 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 FBXO43Q4G163 708 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 CTXN3Q4LDR2 81 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 FAM69BQ5VUD6 431 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 RETSATQ6NUM9 610 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 KLHL24Q6TFL4 600 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 MON1AQ86VX9 555 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 GHDCQ8N2G8 530 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 RFWD2Q8NHY2 731 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 TRIB2Q92519 343 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 HES6Q96HZ4 224 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 PAGR1Q9BTK6 254 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 RASSF1Q9NS23 344 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ANKRD10Q9NXR5 420 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 KIF17Q9P2E2 1029 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 NFS1Q9Y697 457 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 MAGEA13PA6NCF6 341 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 PRSS47A8MTI9 375 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 J3KR12 359 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 EBAG9O00559 213 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 GRID2O43424 1007 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 SLC25A17O43808 307 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 UMODP07911 640 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 DHRS4L1P0CG22 281 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 CD72P21854 359 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 CHKAP35790 457 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 LIFRP42702 1097 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 PEX5P50542 639 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 CAPSQ13938 189 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 PRKG1Q13976 671 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 POSTNQ15063 836 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 SLC18A3Q16572 532 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 XKR9Q5GH70 373 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 SFTPA2Q8IWL1 248 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 PGBD5Q8N414 524 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 TMEM57Q8N5G2 664 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ANKRD44Q8N8A2 993 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 SPPL3Q8TCT6 385 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 HSPH1Q92598 858 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 BICD1Q96G01 975 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 IL17FQ96PD4 163 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 YME1L1Q96TA2 773 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 OR6C3Q9NZP0 311 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms