RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 RSPH3Q86UC2 560 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 WDR5BQ86VZ2 330 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 PDSS2Q86YH6 399 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 TREML1Q86YW5 311 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 EGFL6Q8IUX8 553 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CCNJLQ8IV13 435 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 IGDCC3Q8IVU1 814 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 UNC45BQ8IWX7 931 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 KBTBD2Q8IY47 623 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 LRRC43Q8N309 656 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 NME8Q8N427 588 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CCDC33Q8N5R6 958 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 OR5B17Q8NGF7 314 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 GAB3Q8WWW8 586 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 LZICQ8WZA0 190 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 IRGQQ8WZA9 623 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 TTC17Q96AE7 1141 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 FAF2Q96CS3 445 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM169Q96HH4 297 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 PANX3Q96QZ0 392 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CNPY3Q9BT09 278 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 SPATA16Q9BXB7 569 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ADAMTS10Q9H324 1103 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 VRTNQ9H8Y1 702 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CYP3A43Q9HB55 503 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 IFT122Q9HBG6 1241 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 USP29Q9HBJ7 922 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 S100A14Q9HCY8 104 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ENAMQ9NRM1 1142 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 KLHL11Q9NVR0 708 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 DNAJC28Q9NX36 388 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 PLK2Q9NYY3 685 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 SLC7A8Q9UHI5 535 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 KIAA1257Q9ULG3 409 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 TMCO1Q9UM00 188 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CREBBPQ92793 2442 aa7.34□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 A0A088AWK7 358 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 FAM170AA1A519 330 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 WDR91A4D1P6 747 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 B8ZZF3 427 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 OGTO15294 1046 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 DENRO43583 198 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 GCATO75600 419 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 RNF8O76064 485 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 STAU1O95793 577 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 APOEP02649 317 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 AMPD1P23109 780 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ATICP31939 592 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ASPAP45381 313 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 MAPK8P45983 427 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ACOT2P49753 483 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CSRP3P50461 194 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 HK2P52789 917 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 BCAR1P56945 870 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 MYL6P60660 151 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 IGBP1P78318 339 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 TMPRSS15P98073 1019 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 GAD2Q05329 585 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 STX3Q13277 289 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 LSAMPQ13449 338 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 BIRC2Q13490 618 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 TUBB3Q13509 450 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PTPN20Q4JDL3 420 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 BOLA3Q53S33 107 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 EFHC1Q5JVL4 640 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 RNF220Q5VTB9 566 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 METTL21CQ5VZV1 264 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 SLC9A4Q6AI14 798 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 SWSAP1Q6NVH7 229 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 DENND1BQ6P3S1 775 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 IZUMO2Q6UXV1 221 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 SLC24A5Q71RS6 500 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 DHDDSQ86SQ9 333 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 XYLT1Q86Y38 959 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 RFX6Q8HWS3 928 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 NUDCD3Q8IVD9 361 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 MAP7D3Q8IWC1 876 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 VWA5B2Q8N398 1253 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 FAM71DQ8N9W8 422 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 KCTD6Q8NC69 237 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 RNF169Q8NCN4 708 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 OR6Y1Q8NGX8 325 aa7.33□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 GSDMBQ8TAX9 411 aa7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms