RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512107.5

MATR3-238, Transcript of matrin 3, human

TSL 4

Gene MATR3, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-238	ENST00000512107	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	14.73	□□□□□ -0.05	5e-8	■■■■■ 26.8
MATR3-238	ENST00000512107	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	UBP1	Q9NZI7	540 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	IL36A	Q9UHA7	158 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	CDC23	Q9UJX2	597 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	C5orf60	A6NFR6	353 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	ATG13	O75143	517 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	IGSF6	O95976	241 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	PRL	P01236	227 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	UGT2B4	P06133	528 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	ITGAV	P06756	1048 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	PDHA1	P08559	390 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	PSMB4	P28070	264 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	CD86	P42081	329 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	CSNK1D	P48730	415 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	FNTB	P49356	437 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	DGKE	P52429	567 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	ITK	Q08881	620 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	CST6	Q15828	149 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	KDELC1	Q6UW63	502 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	PID1	Q7Z2X4	250 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	RLN3	Q8WXF3	142 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	SPATA13	Q96N96	652 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	MYLK	Q15746	1914 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	FZD6	O60353	706 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	GCAT	O75600	419 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	IL1B	P01584	269 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	TIMP2	P16035	220 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	SLC8A1	P32418	973 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	ABL2	P42684	1182 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	MAGEA9	P43362	315 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	CCR3	P51677	355 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	TAS2R38	P59533	333 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107	GGT7	Q9UJ14	662 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MATR3-238	ENST00000512107		A0A1W2PP55	124 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MATR3-238	ENST00000512107	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
MATR3-238	ENST00000512107	APBB3	O95704	486 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MATR3-238	ENST00000512107	CNTN1	Q12860	1018 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MATR3-238	ENST00000512107	SPARCL1	Q14515	664 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MATR3-238	ENST00000512107	STARD3	Q14849	445 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MATR3-238	ENST00000512107	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MATR3-238	ENST00000512107	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MATR3-238	ENST00000512107	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
MATR3-238	ENST00000512107	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
MATR3-238	ENST00000512107	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MATR3-238	ENST00000512107	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MATR3-238	ENST00000512107	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MATR3-238	ENST00000512107	TMIE	Q8NEW7	156 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MATR3-238	ENST00000512107	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MATR3-238	ENST00000512107	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MATR3-238	ENST00000512107	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MATR3-238	ENST00000512107	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MATR3-238	ENST00000512107	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MATR3-238	ENST00000512107	FCRL5	Q96RD9	977 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MATR3-238	ENST00000512107	TRIB3	Q96RU7	358 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MATR3-238	ENST00000512107	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
MATR3-238	ENST00000512107	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
MATR3-238	ENST00000512107	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MATR3-238	ENST00000512107	GBA3	Q9H227	469 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MATR3-238	ENST00000512107	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MATR3-238	ENST00000512107	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
MATR3-238	ENST00000512107	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06

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