RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494297.5

SRPRB-205, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-205ENST00000494297 TGM2P21980 687 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 TGM1P22735 817 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 CES1P23141 567 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 ITGB7P26010 798 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 HOXD12P35452 270 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 CETN2P41208 172 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 MAPK8P45983 427 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 PSMD8P48556 350 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 DNA2P51530 1060 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 CCR5P51681 352 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 METAP1P53582 386 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 RHOAP61586 193 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 GBE1Q04446 702 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 ADCY2Q08462 1091 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 SLC10A7Q0GE19 358 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 TFDP2Q14188 446 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 PDK1Q15118 436 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 MSS51Q4VC12 460 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF805Q5CZA5 627 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 SYCP2LQ5T4T6 812 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 MEI1Q5TIA1 1274 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 MARC1Q5VT66 337 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 AGBL4Q5VU57 503 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 ALG1LQ6GMV1 187 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 NCEH1Q6PIU2 408 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 GDPD4Q6W3E5 623 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 PEX26Q7Z412 305 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 RFX6Q8HWS3 928 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 SYT12Q8IV01 421 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 REXO1L1PQ8IX06 675 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 TMEFF1Q8IYR6 380 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 BBS5Q8N3I7 341 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 ATPAF2Q8N5M1 289 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 UBL4BQ8N7F7 174 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 NETO2Q8NC67 525 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 OR2T34Q8NGX1 318 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 NSMCE1Q8WV22 266 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 RUBCNQ92622 972 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 ALG3Q92685 438 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 P3H4Q92791 437 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 RAB7BQ96AH8 199 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 ARRDC3Q96B67 414 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 PPP1R16AQ96I34 528 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 OLFM3Q96PB7 478 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 NUDCD1Q96RS6 583 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 OMDQ99983 421 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 MGME1Q9BQP7 344 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 GPR174Q9BXC1 333 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 TM6SF2Q9BZW4 377 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 KCNF1Q9H3M0 494 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 PREBQ9HCU5 417 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 DKK3Q9UBP4 350 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 SERGEFQ9UGK8 458 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 SEPT3Q9UH03 358 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 GMEB2Q9UKD1 530 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 PILRBQ9UKJ0 227 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 GUCA1BQ9UMX6 200 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa5.45□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 DOCK4Q8N1I0 1966 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 TBC1D3EA0A087X179 549 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 TSPAN11A1L157 253 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 LRRC72A6NJI9 287 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 C16orf96A6NNT2 1141 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 HACD1B0YJ81 288 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 TBC1D3LB9A6J9 549 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 J3QL48 77 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 KRIT1O00522 736 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 MUSKO15146 869 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 INSIG1O15503 277 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 ZSCAN12O43309 604 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 WIPF1O43516 503 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 LATO43561 262 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 TJP3O95049 919 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 SEMA4FO95754 770 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 FTCDO95954 541 aa5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms