RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487269.1

FAM204A-208, Transcript of family with sequence similarity 204 member A, human

TSL 2

Gene FAM204A, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM204A-208	ENST00000487269	ILK	Q13418	452 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM204A-208	ENST00000487269	NCAPH	Q15003	741 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM204A-208	ENST00000487269	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
FAM204A-208	ENST00000487269	MYLK3	Q32MK0	819 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM204A-208	ENST00000487269	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM204A-208	ENST00000487269	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM204A-208	ENST00000487269	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM204A-208	ENST00000487269	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
FAM204A-208	ENST00000487269	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM204A-208	ENST00000487269	NTAN1	Q96AB6	310 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM204A-208	ENST00000487269	HMCES	Q96FZ2	354 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM204A-208	ENST00000487269	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
FAM204A-208	ENST00000487269	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM204A-208	ENST00000487269	MAGEH1	Q9H213	219 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM204A-208	ENST00000487269	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
FAM204A-208	ENST00000487269	TMEM51	Q9NW97	253 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM204A-208	ENST00000487269	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM204A-208	ENST00000487269	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM204A-208	ENST00000487269	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
FAM204A-208	ENST00000487269	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM204A-208	ENST00000487269	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	AREL1	O15033	823 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	SCAMP1	O15126	338 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	BUB1	O43683	1085 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	KDELR3	O43731	214 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	OPA1	O60313	960 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	MMP20	O60882	483 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	GSR	P00390	522 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	CKMT1A	P12532	417 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	TIMP2	P16035	220 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	PFN3	P60673	137 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	UBXN1	Q04323	297 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	PLPP6	Q8IY26	295 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	RBFA	Q8N0V3	343 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	C3orf20	Q8ND61	904 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	NEK11	Q8NG66	645 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	EXOC2	Q96KP1	924 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	MCEE	Q96PE7	176 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	AGPAT1	Q99943	283 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	MGA	Q8IWI9	3026 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	RASA4B	C9J798	803 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	NEMP1	O14524	444 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	RASA4	O43374	803 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	TSPAN6	O43657	245 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	CREB3	O43889	395 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	GCAT	O75600	419 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	CSF2	P04141	144 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	ATP1A3	P13637	1013 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	EPHB2	P29323	1055 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	IGFALS	P35858	605 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	ETFB	P38117	255 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	ABCG1	P45844	678 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	RABIF	P47224	123 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	MYL5	Q02045	173 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	SGCG	Q13326	291 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	CYTH1	Q15438	398 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	VPS36	Q86VN1	386 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	PARG	Q86W56	976 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	CENPT	Q96BT3	561 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	IFT43	Q96FT9	208 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	LHX3	Q9UBR4	397 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	FZD10	Q9ULW2	581 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	KALRN	O60229	2985 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		12.06	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	FPGT	O14772	594 aa		12.06	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	TEX33	O43247	280 aa		12.06	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	PIGN	O95427	931 aa		12.06	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	MPO	P05164	745 aa		12.06	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	CALB1	P05937	261 aa		12.06	□□□□□ -0.48
FAM204A-208	ENST00000487269	TPM2	P07951	284 aa		12.06	□□□□□ -0.48

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