RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479541.1

RNF216-208, Transcript of ring finger protein 216, human

TSL 4

Gene RNF216, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF216-208	ENST00000479541	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	TMCC2	O75069	709 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	PLAU	P00749	431 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	GALT	P07902	379 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	ST6GAL1	P15907	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	LMO1	P25800	156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	GABRB2	P47870	512 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	PRAME	P78395	509 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	CYP4A11	Q02928	519 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	CRYM	Q14894	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	WTAP	Q15007	396 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	TAF11	Q15544	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	CDC73	Q6P1J9	531 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	CHSY1	Q86X52	802 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	NEK9	Q8TD19	979 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	RITA1	Q96K30	269 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	KIAA1456	Q9P272	454 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	ICK	Q9UPZ9	632 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541		B4DLN1	442 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	RRH	O14718	337 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	ADA	P00813	363 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	YWHAQ	P27348	245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	HOXD13	P35453	343 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	TUBA4A	P68366	448 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	CHAF1B	Q13112	559 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	VEPH1	Q14D04	833 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	COLEC12	Q5KU26	742 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	C17orf99	Q6UX52	265 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	FAM160B2	Q86V87	743 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	CNTROB	Q8N137	903 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	PLD5	Q8N7P1	536 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	ZNF398	Q8TD17	642 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	SCFD2	Q8WU76	684 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	FAR1	Q8WVX9	515 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	ERP27	Q96DN0	273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	ITPA	Q9BY32	194 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	BRF2	Q9HAW0	419 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	CDH22	Q9UJ99	828 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	NWD1	Q149M9	1564 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	KIF14	Q15058	1648 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	UTRN	P46939	3433 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541		A0A1W2PQM1	296 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	PTGES3L	E9PB15	166 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	PROP1	O75360	226 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	TACC1	O75410	805 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	SLC2A4	P14672	509 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	KLRC2	P26717	231 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	RAD52	P43351	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	OLR1	P78380	273 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	ZBTB16	Q05516	673 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF216-208	ENST00000479541	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63

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