RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.11□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.11□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 PEMTQ9UBM1 199 aa7.11□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa7.11□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 ARHGAP10A1A4S6 786 aa7.1□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 IKBKBO14920 756 aa7.1□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 ASAP2O43150 1006 aa7.1□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 SOX30O94993 753 aa7.1□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 EDN2P20800 178 aa7.1□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 CXCR3P49682 368 aa7.1□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 ZXDBP98169 803 aa7.1□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 LTBQ06643 244 aa7.1□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.1□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa7.1□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 PLD5Q8N7P1 536 aa7.1□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.1□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa7.1□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 CBY3A6NI87 242 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 ATP2C2O75185 946 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 URODP06132 367 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 TFPIP10646 304 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 ITGB8P26012 769 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 LIFRP42702 1097 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 TLE2Q04725 743 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 RUNX2Q13950 521 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 CES5AQ6NT32 575 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 LRRC8DQ7L1W4 858 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 FAM160B2Q86V87 743 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 DENND6AQ8IWF6 608 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 ELP5Q8TE02 316 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 ZBTB10Q96DT7 871 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 CDT1Q9H211 546 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 SNTG1Q9NSN8 517 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 IL36RNQ9UBH0 155 aa7.09□□□□□ -1.27
SGCE-210ENST00000472326 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 SLC28A2O43868 658 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 CBSLP0DN79 551 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 CBSP35520 551 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 GGT5P36269 586 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 BLKP51451 505 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 CDH15P55291 814 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 EGR4Q05215 589 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 TRPC3Q13507 836 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 SHBQ15464 509 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 FJX1Q86VR8 437 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 ZMIZ2Q8NF64 920 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 TNIP2Q8NFZ5 429 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 OR14A16Q8NHC5 309 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 HVCN1Q96D96 273 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 NUF2Q9BZD4 464 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 TMEM51Q9NW97 253 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 ZNF580Q9UK33 172 aa7.08□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 SLC2A4P14672 509 aa7.07□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 RYKP34925 604 aa7.07□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 GPD2P43304 727 aa7.07□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 AMTP48728 403 aa7.07□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 PDLIM4P50479 330 aa7.07□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 EFNB1P98172 346 aa7.07□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 CYP4A11Q02928 519 aa7.07□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 DSC1Q08554 894 aa7.07□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 GALNT2Q10471 571 aa7.07□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 ZNF766Q5HY98 468 aa7.07□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa7.07□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 GORABQ5T7V8 394 aa7.07□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 PHF21BQ96EK2 531 aa7.07□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 MED30Q96HR3 178 aa7.07□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 HEMGNQ9BXL5 484 aa7.07□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 BABAM1Q9NWV8 329 aa7.07□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.06□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 TEX22C9J3V5 150 aa7.06□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 EBAG9O00559 213 aa7.06□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 TIMM23O14925 209 aa7.06□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 GUCY1B2O75343 617 aa7.06□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 PRSS2P07478 247 aa7.06□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 SRD5A1P18405 259 aa7.06□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 TRAF3Q13114 568 aa7.06□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 GPAT4Q86UL3 456 aa7.06□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 TMTC1Q8IUR5 882 aa7.06□□□□□ -1.28
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