RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 FADS3Q9Y5Q0 445 aa24.31■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa24.3■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 TLR4O00206 839 aa24.3■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 DFNA5O60443 496 aa24.3■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 GJC1P36383 396 aa24.3■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 CCT8P50990 548 aa24.3■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 CDH6P55285 790 aa24.3■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 SEL1L3Q68CR1 1132 aa24.3■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa24.3■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 RAB7BQ96AH8 199 aa24.3■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 VOPP1Q96AW1 172 aa24.3■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 MYOCQ99972 504 aa24.3■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 GDF3Q9NR23 364 aa24.3■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 ETNK2Q9NVF9 386 aa24.3■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 LCMT1Q9UIC8 334 aa24.3■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 CA5BQ9Y2D0 317 aa24.3■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa24.3■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa24.3■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM131Q92545 1883 aa24.3■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 NEMP1O14524 444 aa24.29■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 INSIG1O15503 277 aa24.29■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 AP1G1O43747 822 aa24.29■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 PALMO75781 387 aa24.29■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 ABL2P42684 1182 aa24.29■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 RPS21P63220 83 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa24.29■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa24.29■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 IQCHQ86VS3 1027 aa24.29■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 CPNE8Q86YQ8 564 aa24.29■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 TP53INP2Q8IXH6 220 aa24.29■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 RBSNQ9H1K0 784 aa24.29■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa24.28■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 AKT2P31751 481 aa24.28■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 NXPH1P58417 271 aa24.28■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 FAM193AP78312 1265 aa24.28■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 IL9RQ01113 521 aa24.28■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 IL10RBQ08334 325 aa24.28■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM259Q4ZIN3 620 aa24.28■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 TTC7BQ86TV6 843 aa24.28■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 TSC1Q92574 1164 aa24.28■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 TRPM6Q9BX84 2022 aa24.28■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 A0A1B0GTQ1 180 aa24.27■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 FLRT2O43155 660 aa24.27■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 TSPAN6O43657 245 aa24.27■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 MAGEC1O60732 1142 aa24.27■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 PMLP29590 882 aa24.27■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 OVGP1Q12889 678 aa24.27■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 GRM3Q14832 879 aa24.27■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa24.27■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM145Q8NBT3 493 aa24.27■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 SLC35G2Q8TBE7 412 aa24.27■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 KLHDC7BQ96G42 594 aa24.27■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 SLC17A9Q9BYT1 436 aa24.27■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 FZD3Q9NPG1 666 aa24.27■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 DKK3Q9UBP4 350 aa24.27■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa24.27■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 ITM2BQ9Y287 266 aa24.27■■□□□ 1.48
SMKR1-201ENST00000462322 PIGNO95427 931 aa24.26■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 CD48P09326 243 aa24.26■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 SERPINB6P35237 376 aa24.26■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 TAS2R40P59535 323 aa24.26■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 MMRN1Q13201 1228 aa24.26■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 MESDQ14696 234 aa24.26■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 LRRC73Q5JTD7 316 aa24.26■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 DBX2Q6ZNG2 339 aa24.26■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 TC2NQ8N9U0 490 aa24.26■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 KCTD6Q8NC69 237 aa24.26■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 FAM71BQ8TC56 605 aa24.26■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 RHBDD1Q8TEB9 315 aa24.26■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 CALN1Q9BXU9 219 aa24.26■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 GGT7Q9UJ14 662 aa24.26■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 PCDHGA12O60330 932 aa24.25■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 KRT7P08729 469 aa24.25■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 XPAP23025 273 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 IL4RP24394 825 aa24.25■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 MAN1A1P33908 653 aa24.25■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 RGRP47804 291 aa24.25■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 CSNK1DP48730 415 aa24.25■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF75DP51815 510 aa24.25■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 FOXC1Q12948 553 aa24.25■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 SGCGQ13326 291 aa24.25■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 TMCO4Q5TGY1 634 aa24.25■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 SRLQ86TD4 932 aa24.25■■□□□ 1.47
SMKR1-201ENST00000462322 ZSCAN30Q86W11 494 aa24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms