RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460231.5

PCNP-202, Transcript of PEST proteolytic signal containing nuclear protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PCNP, Length 2,165 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNP-202ENST00000460231 TMBIM4Q9HC24 238 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 EURLQ9NYK6 297 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 GGA2Q9UJY4 613 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 PSAT1Q9Y617 370 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 LAMA1P25391 3075 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 GRXCR2A6NFK2 248 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 BNIP3LO60238 219 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 PIGNO95427 931 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 LAMP2P13473 410 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 SEMG2Q02383 582 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 IFFO1Q0D2I5 559 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 COL19A1Q14993 1142 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 SIRPB2Q5JXA9 342 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 ATAT1Q5SQI0 421 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 PALM2Q8IXS6 379 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 MYO19Q96H55 970 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 TRIB3Q96RU7 358 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 KIF9Q9HAQ2 790 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 GDE1Q9NZC3 331 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 TULP3O75386 442 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 CYBBP04839 570 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 ADH5P11766 374 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 SRCP12931 536 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 SLC8A1P32418 973 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 ABCG1P45844 678 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 PGGT1BP53609 377 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 TRAF2Q12933 501 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 ALG1LQ6GMV1 187 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 ZSWIM9Q86XI8 627 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 FOXP3Q9BZS1 431 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 LRRC40Q9H9A6 602 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 DONSONQ9NYP3 566 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 SEPT3Q9UH03 358 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 HCN2Q9UL51 889 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 SDR42E2A6NKP2 422 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 CPP00450 1065 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 ERVK-10P10266 1014 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 ARNTP27540 789 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 GMPRP36959 345 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 CBX1P83916 185 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 CDK16Q00536 496 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 CRYMQ14894 314 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 SLC1A5Q15758 541 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 LRIG3Q6UXM1 1119 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 CAMK1DQ8IU85 385 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 ATP11CQ8NB49 1132 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 FSD1LQ9BXM9 530 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 ECT2Q9H8V3 914 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 TRPV4Q9HBA0 871 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 ZFP14Q9HCL3 533 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 TBC1D14Q9P2M4 693 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 SPO11Q9Y5K1 396 aa14.5□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 SOBPA7XYQ1 873 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 KCNA5P22460 613 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 KDSRQ06136 332 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 CBLBQ13191 982 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 PTPRNQ16849 979 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 SPDYCQ5MJ68 293 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 MRGPRX3Q96LB0 322 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 ZNF599Q96NL3 588 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 AGAP2Q99490 1192 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 MARK1Q9P0L2 795 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 FBXO10Q9UK96 956 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 NUMBLQ9Y6R0 609 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 SPEGQ15772 3267 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 TTC34A8MYJ7 566 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 WASH3PC4AMC7 463 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 ARNTLO00327 626 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 RASGRF2O14827 1237 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 ANXA9O76027 345 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 MLNP12872 115 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 GEMP55040 296 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 RHOAP61586 193 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 FCHO2Q0JRZ9 810 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 LRRC73Q5JTD7 316 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 CES5AQ6NT32 575 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 ZNF783Q6ZMS7 281 aa14.49□□□□□ -0.09
PCNP-202ENST00000460231 Q6ZVU0 165 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 655 ms