RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 SLCO4A1Q96BD0 722 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 SCYL1Q96KG9 808 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 SNX27Q96L92 541 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 EBF1Q9UH73 591 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC8A2Q9UPR5 921 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAH12Q6ZR08 3092 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM221A6NGB7 291 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 UNCXA6NJT0 531 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 SLCO1B7G3V0H7 640 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 APOA4P06727 396 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ERCC2P18074 760 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 RHDQ02161 417 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBTB6Q15916 424 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 KCTD11Q693B1 232 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 LSMEM2Q8N112 164 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 CRYBG2Q8N1P7 616 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 SPATA6LQ8N4H0 392 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 NPWQ8N729 165 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC52Q8N7C0 313 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 HSFY1Q96LI6 401 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 APBA2Q99767 749 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 VTA1Q9NP79 307 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ANLNQ9NQW6 1124 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 TLK1Q9UKI8 766 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 SNX13Q9Y5W8 968 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 SHROOM3Q8TF72 1996 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 BEST1O76090 585 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 SMPD1P17405 629 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBTB17Q13105 803 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF460Q14592 562 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ANO4Q32M45 955 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 GK5Q6ZS86 529 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 HFE2Q6ZVN8 426 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 BEST2Q8NFU1 509 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 NPLOC4Q8TAT6 608 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 RDH11Q8TC12 318 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ISOC1Q96CN7 298 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD60Q9BZ19 345 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 VPS45Q9NRW7 570 aa18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 DOCK3Q8IZD9 2030 aa18.52■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNU1A8MYU2 1149 aa18.52■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 E7ENX8 843 aa18.52■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 I6L893 689 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 CLDN5O00501 218 aa18.52■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 CYP2B6P20813 491 aa18.52■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 PSMD8P48556 350 aa18.52■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 GRB14Q14449 540 aa18.52■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 USP10Q14694 798 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXO47Q5MNV8 452 aa18.52■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 HMBOX1Q6NT76 420 aa18.52■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 GPR141Q7Z602 305 aa18.52■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 HERC6Q8IVU3 1022 aa18.52■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 TOP1MTQ969P6 601 aa18.52■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 NPY6RQ99463 290 aa18.52■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 GPR22Q99680 433 aa18.52■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 CIB1Q99828 191 aa18.52■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 C16orf70Q9BSU1 422 aa18.52■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 CPA4Q9UI42 421 aa18.52■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 CROCCQ5TZA2 2017 aa18.52■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 DAB1O75553 588 aa18.52■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 CABYRO75952 493 aa18.52■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC35E2BP0CK96 405 aa18.52■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 NFKB1P19838 968 aa18.52■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 AKAP5P24588 427 aa18.52■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 PRKAA2P54646 552 aa18.52■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 FKBP1BP68106 108 aa18.52■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 GPR180Q86V85 440 aa18.52■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 PPTC7Q8NI37 304 aa18.52■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 GIPC3Q8TF64 312 aa18.52■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 LPGAT1Q92604 370 aa18.52■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 NT5C3BQ969T7 300 aa18.52■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 OMDQ99983 421 aa18.52■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 SNX25Q9H3E2 840 aa18.52■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 CSRP3P50461 194 aa18.51■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 RABGGTBP53611 331 aa18.51■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 CTBSQ01459 385 aa18.51■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKDD1AQ495B1 522 aa18.51■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBED5Q49AG3 693 aa18.51■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 CCNYL1Q8N7R7 359 aa18.51■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms