RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 GDPD4Q6W3E5 623 aa20.52■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 IQCHQ86VS3 1027 aa20.52■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM145Q8NBT3 493 aa20.52■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 FEM1CQ96JP0 617 aa20.52■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 DEF6Q9H4E7 631 aa20.52■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 FZD3Q9NPG1 666 aa20.52■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 INSIG1O15503 277 aa20.51■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 AP1G1O43747 822 aa20.51■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 MAGEC1O60732 1142 aa20.51■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 SPINK2P20155 84 aa20.51■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 AMPD1P23109 780 aa20.51■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 AKT2P31751 481 aa20.51■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 SSR1P43307 286 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 RPS21P63220 83 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 OVGP1Q12889 678 aa20.51■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa20.51■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 POLNQ7Z5Q5 900 aa20.51■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 TEKT4Q8WW24 435 aa20.51■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 RAB7BQ96AH8 199 aa20.51■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 KLHDC7BQ96G42 594 aa20.51■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 PACSIN1Q9BY11 444 aa20.51■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 SP110Q9HB58 689 aa20.51■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 ABHD10Q9NUJ1 306 aa20.51■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa20.51■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 WASF3Q9UPY6 502 aa20.51■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 ITM2BQ9Y287 266 aa20.51■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa20.51■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa20.5■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 NEMP1O14524 444 aa20.5■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 TSPAN6O43657 245 aa20.5■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 AKR1B10O60218 316 aa20.5■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 MFAP3LO75121 409 aa20.5■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 GRK6P43250 576 aa20.5■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 ADKP55263 362 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 SHBQ15464 509 aa20.5■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa20.5■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 GLRX5Q86SX6 157 aa20.5■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 GATAD2AQ86YP4 633 aa20.5■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 TP53INP2Q8IXH6 220 aa20.5■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 CDC6Q99741 560 aa20.5■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC17A9Q9BYT1 436 aa20.5■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa20.5■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 GGT7Q9UJ14 662 aa20.5■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 ANKRD36A6QL64 1941 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 PALMO75781 387 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 H2AFZP0C0S5 128 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 FTH1P19P0C7X4 201 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 CLDN2P57739 230 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 FGL2Q14314 439 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRC73Q5JTD7 316 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 TMCO3Q6UWJ1 677 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 H2AFVQ71UI9 128 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 TTC7BQ86TV6 843 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 OXR1Q8N573 874 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 LZTR1Q8N653 840 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 CSPG4P5Q96PW8 444 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 CHP1Q99653 195 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 SCNM1Q9BWG6 230 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDH18Q9HCL0 1135 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 ETNK2Q9NVF9 386 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 UVRAGQ9P2Y5 699 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 DKK3Q9UBP4 350 aa20.49■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 IGLON5A6NGN9 336 aa20.48■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 YKT6O15498 198 aa20.48■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 SPINT1O43278 529 aa20.48■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 PIGNO95427 931 aa20.48■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 ITGAVP06756 1048 aa20.48■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 THEGLP0DJG4 465 aa20.48■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 IL10RBQ08334 325 aa20.48■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 KRT81Q14533 505 aa20.48■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 HADHQ16836 314 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 INAVAQ3KP66 663 aa20.48■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 GCNT7Q6ZNI0 430 aa20.48■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 CPNE8Q86YQ8 564 aa20.48■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 SAP25Q8TEE9 199 aa20.48■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 SHROOM3Q8TF72 1996 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 AREL1O15033 823 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM16O95361 564 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 TIMP2P16035 220 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 GJC1P36383 396 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 RGRP47804 291 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 RXRGP48443 463 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 CDH6P55285 790 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 SGCGQ13326 291 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms