RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 GDPD4Q6W3E5 623 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 GLRX5Q86SX6 157 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 LZTR1Q8N653 840 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 NPWQ8N729 165 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 RHBDD1Q8TEB9 315 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 TEKT4Q8WW24 435 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 KLK6Q92876 244 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 FEM1CQ96JP0 617 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 KLHL32Q96NJ5 620 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 FRYQ5TBA9 3013 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 H3BRJ5 948 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 PRLRP16471 622 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 ABL2P42684 1182 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 RPS21P63220 83 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 POLNQ7Z5Q5 900 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 HSPH1Q92598 858 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 ABHD10Q9NUJ1 306 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 CA5BQ9Y2D0 317 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 BTBD3Q9Y2F9 522 aa20.87■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 TSPAN6O43657 245 aa20.86■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 TRIM16O95361 564 aa20.86■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 TPM1P09493 284 aa20.86■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 H2AFZP0C0S5 128 aa20.86■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 AKT2P31751 481 aa20.86■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 ARL4AP40617 200 aa20.86■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 GRK6P43250 576 aa20.86■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 RXRGP48443 463 aa20.86■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 IL9RQ01113 521 aa20.86■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 SHBQ15464 509 aa20.86■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 H2AFVQ71UI9 128 aa20.86■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 OXR1Q8N573 874 aa20.86■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 CDC6Q99741 560 aa20.86■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC17A9Q9BYT1 436 aa20.86■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 DKK3Q9UBP4 350 aa20.86■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 EPG5Q9HCE0 2579 aa20.86■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa20.86■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 DFFAO00273 331 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 AREL1O15033 823 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 YKT6O15498 198 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 INSIG1O15503 277 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 MFAP3LO75121 409 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 KLHDC7BQ96G42 594 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 EXOC2Q96KP1 924 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 CSPG4P5Q96PW8 444 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 CHP1Q99653 195 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 MYOCQ99972 504 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 PACSIN1Q9BY11 444 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 DEF6Q9H4E7 631 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDH18Q9HCL0 1135 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 FZD3Q9NPG1 666 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 UVRAGQ9P2Y5 699 aa20.85■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 SPINT1O43278 529 aa20.84■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 PALMO75781 387 aa20.84■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 AMPD1P23109 780 aa20.84■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 ADKP55263 362 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 IL10RBQ08334 325 aa20.84■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 FGL2Q14314 439 aa20.84■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 GRM3Q14832 879 aa20.84■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 SARM1Q6SZW1 724 aa20.84■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa20.84■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 TTC7BQ86TV6 843 aa20.84■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM174AQ8TBP5 190 aa20.84■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM71BQ8TC56 605 aa20.84■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 HCAR2Q8TDS4 363 aa20.84■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 SAP25Q8TEE9 199 aa20.84■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 TSC1Q92574 1164 aa20.84■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 SP110Q9HB58 689 aa20.84■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 ETNK2Q9NVF9 386 aa20.84■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa20.84■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 AKAP13Q12802 2813 aa20.84■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 AKR1B10O60218 316 aa20.83■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 FTH1P19P0C7X4 201 aa20.83■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 THEGLP0DJG4 465 aa20.83■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 CSNK1DP48730 415 aa20.83■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 HADHQ16836 314 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 INAVAQ3KP66 663 aa20.83■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 TMCO3Q6UWJ1 677 aa20.83■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 GCNT7Q6ZNI0 430 aa20.83■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa20.83■□□□□ 0.93
UBE2E3-201ENST00000392415 GATAD2AQ86YP4 633 aa20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms