RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291574.8

TRAPPC10-201, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 6,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-201ENST00000291574 ABCG8Q9H221 673 aa13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP13.74□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 30
TRAPPC10-201ENST00000291574 NADKO95544 446 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 TYMPP19971 482 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 TIGD2Q4W5G0 525 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 PHACTR4Q8IZ21 702 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 EPB41L4BQ9H329 900 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 MORF4L1Q9UBU8 362 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 WASF2Q9Y6W5 498 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 CBFA2T3O75081 653 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 TLCD1Q96CP7 247 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF670Q9BS34 389 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 FANCEQ9HB96 536 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 LCA5LO95447 670 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 CNPP09543 421 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 WSCD1Q658N2 575 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 VSIG10LQ86VR7 867 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 CDH22Q9UJ99 828 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 TNS2Q63HR2 1409 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 GRK3P35626 688 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 CRATP43155 626 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 ITGA1P56199 1179 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 MAXP61244 160 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 RPL38P63173 70 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 C19orf60Q96EN9 201 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 PRKAG3Q9UGI9 489 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 FADS3Q9Y5Q0 445 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 CABYRO75952 493 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 SENP8Q96LD8 212 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 IDI2Q9BXS1 227 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRIM8Q9BZR9 551 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 TTYH3Q9C0H2 523 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 FBXO44Q9H4M3 255 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 FZD1Q9UP38 647 aa13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 CYP4B1P13584 511 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 PURAQ00577 322 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 HSPA14Q0VDF9 509 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 SEMA5AQ13591 1074 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 HERC6Q8IVU3 1022 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 ENOPH1Q9UHY7 261 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 GTF2A2P52657 109 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 STX4Q12846 297 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 FNBP1LQ5T0N5 605 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 STXBP5Q5T5C0 1151 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 GAD1Q99259 594 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 OLFM1Q99784 485 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 RTKNQ9BST9 563 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 IDH3BO43837 385 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 PEX2P28328 305 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 PTPRNQ16849 979 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 LDLRAP1Q5SW96 308 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRIM48Q8IWZ4 208 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 CPT1BQ92523 772 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 PROX1Q92786 737 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM134Q9H6X4 195 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 SIN3BO75182 1162 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRMUO75648 421 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 CLCN5P51795 746 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 LPIN1Q14693 890 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 PPM1JQ5JR12 505 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 OLFML1Q6UWY5 402 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 P2RY11Q96G91 374 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 TOR4AQ9NXH8 423 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 IKZF3Q9UKT9 509 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 NRP2O60462 931 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 MT-ND1P03886 318 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 XIAPP98170 497 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 IRF8Q02556 426 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 CAPSQ13938 189 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 CARTPTQ16568 116 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 PTPN20Q4JDL3 420 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 ADCY4Q8NFM4 1077 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 HPS1Q92902 700 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 CDT1Q9H211 546 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 PIK3C2BO00750 1634 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 MMP8P22894 467 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 TAB1Q15750 504 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 UGCGQ16739 394 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 CERCAMQ5T4B2 595 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 NR4A1P22736 598 aa13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms