RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029476.8

Sec22b-201, Transcript of Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sec22b, Length 2,810 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Pdk1Q8BFP9 434 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Lair1Q8BG84 263 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Abraxas1Q8BPZ8 407 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Prkaa2Q8BRK8 552 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Wdr59Q8C0M0 992 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Znf451Q8C0P7 1056 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Dis3lQ8C0S1 1053 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Frs2Q8C180 508 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Ace2Q8R0I0 805 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Vmn1r199Q8R280 367 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Rem2Q8VEL9 341 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr356Q8VFP5 315 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Polr3eQ9CZT4 710 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Arpc5lQ9D898 153 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Htr3bQ9JHJ5 437 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Thap11Q9JJD0 305 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Limd1Q9QXD8 668 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Map3k14Q9WUL6 942 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Disp2Q8CIP5 1345 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm14401A2ARV7 303 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Vmn2r24D3YUI0 854 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 C87414E9PWI7 475 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Fbrsl1E9Q9T0 1031 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm3739L7N296 216 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm6614M0QWR8 670 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 NoctO35710 429 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Lmo2P25801 158 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Tgfb2P27090 414 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Nedd8P29595 81 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Acot8P58137 320 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 YwhaqP68254 245 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Fam20cQ5MJS3 579 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Olfr464Q5SW48 313 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Ifit3Q64345 403 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Znf512Q69Z99 562 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Fam214aQ69ZK7 1075 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Trit1Q80UN9 467 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Cxcr1Q810W6 351 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Cnpy4Q8BQ47 245 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 IrgcQ8C262 412 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Tmem252Q8C353 183 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Prr33Q8C494 260 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Pabpc5Q8C7D3 381 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gbp5Q8CFB4 590 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 HpdlQ8K248 371 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Rab15Q8K386 212 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Dennd2dQ91VV4 469 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Slc35b2Q91ZN5 431 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 LiasQ99M04 373 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Nudt7Q99P30 236 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 MydgfQ9CPT4 166 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Tmem53Q9D0Z3 276 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Spata9Q9D9R3 252 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Lrrc46Q9DAP0 323 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Slc13a2Q9ES88 586 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Ngly1Q9JI78 651 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 PollQ9QXE2 573 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Adam17Q9Z0F8 827 aa11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Wdr46Q9Z0H1 622 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Sec22b-201ENSMUST00000029476 PhipQ8VDD9 1821 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm6370A0A0G2JGX9 315 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Acnat1A2AKK5 416 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 FgaE9PV24 789 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Kbtbd6E9PYD7 486 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Kbtbd7G5E8C2 690 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Znf683I7HJS4 458 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Zfp850J3QPC5 689 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm6309L7N481 315 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 MrasO08989 208 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Ap2a1P17426 977 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gpc4P51655 557 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 CcnfP51944 777 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Arf4P61750 180 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Sephs2P97364 452 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Pla2g5P97391 137 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 AnpepP97449 966 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Fam83hQ148V8 1209 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Pnpla5Q32LZ8 432 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Smyd5Q3TYX3 416 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 StyxQ60969 223 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 RetsatQ64FW2 609 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Ddx55Q6ZPL9 600 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Btnl1Q7TST0 509 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Iars2Q8BIJ6 1012 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Fbxo44Q8BK26 255 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Fra10ac1Q8BP78 315 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gjd4Q8BSD4 364 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Ston2Q8BZ60 895 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Ttc34Q8C0Q3 554 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 TbccQ8VCN9 341 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Slc22a7Q91WU2 540 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Mrps5Q99N87 432 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Tomm70Q9CZW5 611 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 CtsrQ9JIA9 334 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Ggps1Q9WTN0 300 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Ap4b1Q9WV76 738 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm6509A0A0J9YUV1 481 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm8909G3UXE9 396 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Gm6351K9J7D1 481 aa11.64□□□□□ -0.55
Sec22b-201ENSMUST00000029476 Rhox2gL7MUB9 191 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.5 ms