RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	GUSBP11	Q6P575	273 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	FAM72B	Q86X60	149 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	RBFA	Q8N0V3	343 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	MLKL	Q8NB16	471 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	GPT2	Q8TD30	523 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	HAPLN3	Q96S86	360 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	WDR70	Q9NW82	654 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	NEMP2	A6NFY4	417 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	FPGT	O14772	594 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	GFPT2	O94808	682 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	UGT2B4	P06133	528 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	KRT10	P13645	584 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	JUND	P17535	347 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	ITGB7	P26010	798 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	SATB2	Q9UPW6	733 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	AGRP	O00253	132 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	MUSK	O15146	869 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	KLK10	O43240	276 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	AQP9	O43315	295 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	MMP20	O60882	483 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	CSF2	P04141	144 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	UCHL3	P15374	230 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	ADRA1B	P35368	520 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	UBE2H	P62256	183 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	NOMO3	P69849	1222 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	SLC20A2	Q08357	652 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	CCDC14	Q49A88	953 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	PERM1	Q5SV97	790 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	PCSK4	Q6UW60	755 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	TTC7B	Q86TV6	843 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	VPS36	Q86VN1	386 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	CEP44	Q9C0F1	390 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	VPS16	Q9H269	839 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	GCAT	O75600	419 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	CHRNB2	P17787	502 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	RABIF	P47224	123 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	ISX	Q2M1V0	245 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	MYLK3	Q32MK0	819 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	BNIPL	Q7Z465	357 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	PARG	Q86W56	976 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF843	Q8N446	348 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	CCDC185	Q8N715	623 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	IL12RB2	Q99665	862 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	KLC2	Q9H0B6	622 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-262	ENST00000628078	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		13.71	□□□□□ -0.21

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