RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 NLRP14Q86W24 1093 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 TAS1R2Q8TE23 839 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 SLC20A1Q8WUM9 679 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 SEMA4DQ92854 862 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 TLCD1Q96CP7 247 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 ARHGEF26Q96DR7 871 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 SAAL1Q96ER3 474 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 CABS1Q96KC9 395 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 TSPAN18Q96SJ8 248 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 PCDHB18PQ96TA0 734 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 TCHPQ9BT92 498 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 NFKBIZQ9BYH8 718 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 LHX5Q9H2C1 402 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 CCDC134Q9H6E4 229 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 CYP4F11Q9HBI6 524 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 UBN1Q9NPG3 1134 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 TAS2R14Q9NYV8 317 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 GPRC5DQ9NZD1 345 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 ADAM22Q9P0K1 906 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 SENP1Q9P0U3 644 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 ANAPC7Q9UJX3 599 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 ANAPC5Q9UJX4 755 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 CHST2Q9Y4C5 530 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 RIPK3Q9Y572 518 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 FAM169AQ9Y6X4 670 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 WDR81Q562E7 1941 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 PHIPQ8WWQ0 1821 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 ASB14A6NK59 587 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM200CA6NKL6 621 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 E7EVH7 732 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 H0YHG0 523 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 ACKR2O00590 384 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 HBP1O60381 514 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 TTC4O95801 387 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 ASS1P00966 412 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 GASTP01350 101 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 KRT7P08729 469 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 CLTAP09496 248 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 GHRP10912 638 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 TSHRP16473 764 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 TGM1P22735 817 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 MMP8P22894 467 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 GLRA2P23416 452 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 EDNRBP24530 442 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 TMOD1P28289 359 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 MMP13P45452 471 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 CCT5P48643 541 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPRM-215ENST00000583289 SLC18A1P54219 525 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 CCNA1P78396 465 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 MAMLD1Q13495 774 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 SLC29A2Q14542 456 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 KCTD2Q14681 263 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 RASA2Q15283 850 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 ERMARDQ5T6L9 678 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 HECTD2Q5U5R9 776 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 BROXQ5VW32 411 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 SDE2Q6IQ49 451 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 CCDC62Q6P9F0 684 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 DCUN1D2Q6PH85 259 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 C4orf22Q6V702 233 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 CCDC121Q6ZUS5 278 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 GSTA5Q7RTV2 222 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 TADA2BQ86TJ2 420 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 ERICH1Q86X53 443 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 XYLT1Q86Y38 959 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 ERO1BQ86YB8 467 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 BRSK2Q8IWQ3 736 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 THNSL1Q8IYQ7 743 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 NIPA2Q8N8Q9 360 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 OLIG1Q8TAK6 271 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 ATP8B4Q8TF62 1192 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF606Q8WXB4 792 aa4.72□□□□□ -1.65
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