RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 DNAJC28Q9NX36 388 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPSM3Q9Y4H4 160 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACACAQ13085 2346 aa7.3□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADAMTS20P59510 1910 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 ITPR1Q14643 2758 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 DSPP15924 2871 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANKRD62A6NC57 917 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 POM121BA6NF01 834 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGLON5A6NGN9 336 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 C16orf96A6NNT2 1141 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPINT1O43278 529 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 BUB1O43683 1085 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 PIAS2O75928 621 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMCC1O94876 653 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 CALB1P05937 261 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 PTMAP06454 111 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 UNGP13051 313 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 CKMT2P17540 419 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 DGKAP23743 735 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 EPHB2P29323 1055 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 L1CAMP32004 1257 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 ETFBP38117 255 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 RXRGP48443 463 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAPKAPK2P49137 400 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 RHOAP61586 193 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC15Q0P6D6 951 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 OVGP1Q12889 678 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 SGCGQ13326 291 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 TCEA2Q15560 299 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 PROX2Q3B8N5 592 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 EFHC2Q5JST6 749 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 TPRG1LQ5T0D9 272 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 SMYD5Q6GMV2 418 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 Q6ZSR6 202 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 MON1BQ7L1V2 547 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARCQ7LC44 396 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 STRADAQ7RTN6 431 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLFN11Q7Z7L1 901 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 PDZD3Q86UT5 571 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 VPS36Q86VN1 386 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMPRSS12Q86WS5 348 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 DNAAF5Q86Y56 855 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC25A45Q8N413 288 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 RNF214Q8ND24 703 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 C3orf20Q8ND61 904 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR2AP1Q8NGE2 309 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 TSC1Q92574 1164 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 NXPE2Q96DL1 559 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 HMCESQ96FZ2 354 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRIG1Q96JA1 1093 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 KLHL32Q96NJ5 620 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 AGPAT1Q99943 283 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC17A9Q9BYT1 436 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 HPCAL4Q9UM19 191 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 FADS3Q9Y5Q0 445 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 AK5Q9Y6K8 562 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 RASA4BC9J798 803 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 FPGTO14772 594 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 SCAMP1O15126 338 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 INSIG1O15503 277 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 TEX33O43247 280 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 RASA4O43374 803 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 PIGNO95427 931 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGSF6O95976 241 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 GSRP00390 522 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 ITIH2P19823 946 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 ITPKBP27987 946 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPS21P63220 83 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 OGDHQ02218 1023 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 TYRO3Q06418 890 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC20A2Q08357 652 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 FZD2Q14332 565 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 NCAPHQ15003 741 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 DEFB133Q30KQ1 61 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms