RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556017.1

CHMP4BP1-201, Transcript of charged multivesicular body protein 4B pseudogene 1, humanhuman

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Gene CHMP4BP1, Length 588 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1-201ENST00000556017 CCDC114Q96M63 670 aa14.62□□□□□ -0.07
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CHMP4BP1-201ENST00000556017 DEPDC7Q96QD5 511 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP4BP1-201ENST00000556017 HEPHQ9BQS7 1158 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP4BP1-201ENST00000556017 SPON2Q9BUD6 331 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP4BP1-201ENST00000556017 OSBPL2Q9H1P3 480 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP4BP1-201ENST00000556017 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP4BP1-201ENST00000556017 STAP1Q9ULZ2 295 aa14.62□□□□□ -0.07
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CHMP4BP1-201ENST00000556017 AQP9O43315 295 aa14.59□□□□□ -0.07
CHMP4BP1-201ENST00000556017 ALPPL2P10696 532 aa14.59□□□□□ -0.07
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CHMP4BP1-201ENST00000556017 DEFB133Q30KQ1 61 aa14.59□□□□□ -0.07
CHMP4BP1-201ENST00000556017 VWA3BQ502W6 1294 aa14.59□□□□□ -0.07
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CHMP4BP1-201ENST00000556017 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CHMP4BP1-201ENST00000556017 VCPIP1Q96JH7 1222 aa14.59□□□□□ -0.07
CHMP4BP1-201ENST00000556017 SLC46A1Q96NT5 459 aa14.59□□□□□ -0.07
CHMP4BP1-201ENST00000556017 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa14.59□□□□□ -0.07
CHMP4BP1-201ENST00000556017 SALL4Q9UJQ4 1053 aa14.59□□□□□ -0.07
CHMP4BP1-201ENST00000556017 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CHMP4BP1-201ENST00000556017 MAST4O15021 2626 aa14.58□□□□□ -0.08
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CHMP4BP1-201ENST00000556017 TSPAN6O43657 245 aa14.58□□□□□ -0.08
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