RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF544Q6NX49 715 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 TIGD4Q8IY51 512 aa6.38□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 SUSD6Q92537 303 aa6.38□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 HIC1Q14526 733 aa6.37□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 MACC1Q6ZN28 852 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ACAD11Q709F0 780 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 LMAN2LQ9H0V9 348 aa6.37□□□□□ -1.39
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