RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 RBP5P82980 135 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 BNIP2Q12982 314 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 ARMCX2Q7L311 632 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 THNSL1Q8IYQ7 743 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 FITM2Q8N6M3 262 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 PRELID2Q8N945 189 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 TMCO6Q96DC7 493 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 SGF29Q96ES7 293 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
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PTPRD-214ENST00000540109 MLXQ9UH92 298 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 Q9Y3F1 56 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM150BA6NC51 233 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 HMGCRP04035 888 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 MSH3P20585 1137 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 ARSEP51690 589 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 SLC25A3Q00325 362 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
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PTPRD-214ENST00000540109 PPM1LQ5SGD2 360 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 C9orf131Q5VYM1 1079 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 P3H2Q8IVL5 708 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 KYQ8NBH2 561 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 NLGN2Q8NFZ4 835 aa6.12□□□□□ -1.43
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PTPRD-214ENST00000540109 PMEPA1Q969W9 287 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 BCO2Q9BYV7 579 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 TXLNGYQ9BZA5 131 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 ARMC1Q9NVT9 282 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 BFARQ9NZS9 450 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 NEU2Q9Y3R4 380 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 FAM172BPA6NC97 362 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 GLTPD2A6NH11 291 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF487B1APH4 448 aa6.12□□□□□ -1.43
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PTPRD-214ENST00000540109 J3QRK9 145 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 DDNO94850 711 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 C22orf31O95567 290 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 ITGA4P13612 1032 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 FASP25445 335 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 ACOT2P49753 483 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 MBTD1Q05BQ5 628 aa6.12□□□□□ -1.43
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PTPRD-214ENST00000540109 RFWD3Q6PCD5 774 aa6.12□□□□□ -1.43
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PTPRD-214ENST00000540109 FBXL8Q96CD0 374 aa6.12□□□□□ -1.43
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PTPRD-214ENST00000540109 PAK5Q9P286 719 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 PSMD13Q9UNM6 376 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 PTGES3LE9PB15 166 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 F5H423 210 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa6.12□□□□□ -1.43
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PTPRD-214ENST00000540109 KLHL18O94889 574 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 ME2P23368 584 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 RORAP35398 523 aa6.12□□□□□ -1.43
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PTPRD-214ENST00000540109 TRAF3Q13114 568 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 PTK7Q13308 1070 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.12□□□□□ -1.43
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PTPRD-214ENST00000540109 CLHC1Q8NHS4 586 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 ELMO1Q92556 727 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 PIK3R3Q92569 461 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF516Q92618 1163 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 TOP1MTQ969P6 601 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.12□□□□□ -1.43
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PTPRD-214ENST00000540109 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 NR2E3Q9Y5X4 410 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 A0A0G2JPF8 293 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 PROCP04070 461 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 CYP2C8P10632 490 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 SPRP35270 261 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 TGFBR2P37173 567 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 GRM5P41594 1212 aa6.12□□□□□ -1.43
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