RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 USP12O75317 370 aa24.44■■□□□ 1.5
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PTPRJ-205ENST00000527952 LSM8O95777 96 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
PTPRJ-205ENST00000527952 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP24.44■■□□□ 1.51e-6■□□□□ 10
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PTPRJ-205ENST00000527952 DUSP23Q9BVJ7 150 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRJ-205ENST00000527952 NLRC4Q9NPP4 1024 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM51Q9NW97 253 aa24.4■■□□□ 1.5
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PTPRJ-205ENST00000527952 NEU3Q9UQ49 428 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRJ-205ENST00000527952 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
PTPRJ-205ENST00000527952 TSPAN6O43657 245 aa24.39■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
PTPRJ-205ENST00000527952 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
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