RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 GIMAP5Q96F15 307 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM169Q96HH4 297 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 HIPK3Q9H422 1215 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 FBXO44Q9H4M3 255 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 RABGEF1Q9UJ41 708 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 ADAM28Q9UKQ2 775 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 CLUHO75153 1309 aa7.96□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 ARVCFO00192 962 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 NCAM2O15394 837 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 MAGEB3O15480 346 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 TBX18O95935 607 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 EOMESO95936 686 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 ERVK-10P10266 1014 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 NFKB1P19838 968 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 DRD4P21917 467 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 CD9P21926 228 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 KCNJ2P63252 427 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 OLIG2Q13516 323 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 POU6F1Q14863 301 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 GSTA3Q16772 222 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 VSTM1Q6UX27 236 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 SLAIN1Q8ND83 568 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 OR6P1Q8NGX9 317 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 NAT14Q8WUY8 206 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 SUSD3Q96L08 255 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC37BQ96QE4 947 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 IGSF5Q9NSI5 407 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 FBXW11Q9UKB1 542 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 TLK1Q9UKI8 766 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 PHTF1Q9UMS5 762 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 NUMBLQ9Y6R0 609 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP7.96□□□□□ -1.146e-6■■■■■ 111.7
TRPS1-208ENST00000519076 PRRG1O14668 218 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 TP73O15350 636 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 ZWINTO95229 277 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 SCNN1AP37088 669 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 POLD2P49005 469 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 GPR15P49685 360 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 NIPAL4Q0D2K0 466 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 PARP6Q2NL67 630 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 XKR4Q5GH76 650 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 UNC5AQ6ZN44 842 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 Q6ZNX1 250 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF567Q8N184 647 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 MPP5Q8N3R9 675 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 CFAP61Q8NHU2 1237 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 GATA6Q92908 595 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 MAGEB18Q96M61 343 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 SERPINB11Q96P15 392 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP7.96□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 32.9
TRPS1-208ENST00000519076 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 ZBED2Q9BTP6 218 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 MARCH2Q9P0N8 246 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 CDY1Q9Y6F8 540 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 A0A0G2JMZ2 1700 aa7.96□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 IDH3BO43837 385 aa7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 COL6A2P12110 1019 aa7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 TAF10Q12962 218 aa7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 ITGA9Q13797 1035 aa7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 MPP2Q14168 576 aa7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 RCN2Q14257 317 aa7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 SLC1A5Q15758 541 aa7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 PSMD5Q16401 504 aa7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 CEP78Q5JTW2 689 aa7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 UNC5BQ8IZJ1 945 aa7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 LSMEM1Q8N8F7 131 aa7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 AGR3Q8TD06 166 aa7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 CKAP2Q8WWK9 683 aa7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 AIFM2Q9BRQ8 373 aa7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 TSSK1BQ9BXA7 367 aa7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 CYP4F11Q9HBI6 524 aa7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM30AQ9NV96 361 aa7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 SMPD4Q9NXE4 827 aa7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 GMIPQ9P107 970 aa7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 H0YC42 278 aa7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 BNIP3LO60238 219 aa7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 SLC2A3P11169 496 aa7.95□□□□□ -1.14
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