RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 TPSB2P20231 275 aa22.35■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 CES1P23141 567 aa22.35■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 SPARCL1Q14515 664 aa22.35■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 BRD3Q15059 726 aa22.35■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 TPSAB1Q15661 275 aa22.35■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 DLG2Q15700 870 aa22.35■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 PHTF2Q8N3S3 785 aa22.35■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 GORASP1Q9BQQ3 440 aa22.35■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 TNKS2Q9H2K2 1166 aa22.35■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 LHX3Q9UBR4 397 aa22.35■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 TP73O15350 636 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 TMEM63AO94886 807 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 SERPINF2P08697 491 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 ECHS1P30084 290 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 CTHP32929 405 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 RGRP47804 291 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 CDK16Q00536 496 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 PCSK7Q16549 785 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 CCDC25Q86WR0 208 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 IPMKQ8NFU5 416 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 NUDCD1Q96RS6 583 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 FSD1LQ9BXM9 530 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 PRKAG3Q9UGI9 489 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 INSIG1O15503 277 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 GJB3O75712 270 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 AP2A1O95782 977 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 SRFP11831 508 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 MAGEA6P43360 314 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 MPP3Q13368 585 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 DGKKQ5KSL6 1271 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 C22orf39Q6P5X5 142 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 KDELC2Q7Z4H8 507 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 SFTPA1Q8IWL2 248 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 ARRDC2Q8TBH0 407 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 CEP44Q9C0F1 390 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 LRRC40Q9H9A6 602 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 NOD2Q9HC29 1040 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 VPS45Q9NRW7 570 aa22.34■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 CCDC151A5D8V7 595 aa22.33■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 IGSF6O95976 241 aa22.33■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 ALG1LQ6GMV1 187 aa22.33■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 MRGPRX3Q96LB0 322 aa22.33■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 PWWP2AQ96N64 755 aa22.33■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PSPC1-204ENST00000492741 MMP2P08253 660 aa22.32■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 FAM153BP0C7A2 387 aa22.32■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 ARL4CP56559 192 aa22.32■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 SKOR1P84550 965 aa22.32■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 FAM153CQ494X1 144 aa22.32■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa22.32■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 SRLQ86TD4 932 aa22.32■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 DNAAF3Q8N9W5 541 aa22.32■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 MCUQ8NE86 351 aa22.32■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.32■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.32■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 COL4A3Q01955 1670 aa22.32■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 MIA3Q5JRA6 1907 aa22.32■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 TTC34A8MYJ7 566 aa22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 ATP9BO43861 1147 aa22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 USP12O75317 370 aa22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 CR2P20023 1033 aa22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 WNT3AP56704 352 aa22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 ZP2Q05996 745 aa22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 MTM1Q13496 603 aa22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 PON2Q15165 354 aa22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 HIF1AQ16665 826 aa22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 PTPRNQ16849 979 aa22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 KCTD11Q693B1 232 aa22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 TXNDC11Q6PKC3 985 aa22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 LINC00523Q86TU6 105 aa22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 PDIK1LQ8N165 341 aa22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 OR2AP1Q8NGE2 309 aa22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 OR6K2Q8NGY2 324 aa22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 IFT43Q96FT9 208 aa22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 FICDQ9BVA6 458 aa22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 FOXP3Q9BZS1 431 aa22.31■■□□□ 1.16
PSPC1-204ENST00000492741 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
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