RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479554.5

ATG4B-218, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-218ENST00000479554 EFHC2Q5JST6 749 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 SEL1L3Q68CR1 1132 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 FBXL19Q6PCT2 694 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 SLFN11Q7Z7L1 901 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 ZSCAN30Q86W11 494 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 MARCH9Q86YJ5 346 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 MDM1Q8TC05 714 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 MCEEQ96PE7 176 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 CALN1Q9BXU9 219 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 MAGEB5Q9BZ81 275 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 SDC3O75056 442 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 CCDC172P0C7W6 258 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 CDK4P11802 303 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 FERP16591 822 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 DESP17661 470 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 ACADVLP49748 655 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 RPS21P63220 83 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 TMEM259Q4ZIN3 620 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 SCYL2Q6P3W7 929 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF354CQ86Y25 554 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 OR6K2Q8NGY2 324 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 FADS3Q9Y5Q0 445 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 FAM208BQ5VWN6 2430 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 CHD5Q8TDI0 1954 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 A0A1B0GTH6 734 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 A6NNZ2 444 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 ESPNB1AK53 854 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 KRIT1O00522 736 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 AP1G1O43747 822 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 GSRP00390 522 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 C1SP09871 688 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 EPHB2P29323 1055 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 HNF1BP35680 557 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 CLDN2P57739 230 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 GSDMDP57764 484 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 NR1I3Q14994 352 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 DCUN1D2Q6PH85 259 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 LEKR1Q6ZMV7 388 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 GCNT7Q6ZNI0 430 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 TMC6Q7Z403 805 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 TMPRSS12Q86WS5 348 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 VSTM4Q8IW00 320 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 PLPP6Q8IY26 295 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 PYROXD2Q8N2H3 581 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 OR13H1Q8NG92 308 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 OR2AP1Q8NGE2 309 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 LRIG1Q96JA1 1093 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 FEM1CQ96JP0 617 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 EPAS1Q99814 870 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 CNPY3Q9BT09 278 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 KLHL11Q9NVR0 708 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 DOCK9Q9BZ29 2069 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 TRABD2BA6NFA1 517 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 KDELR3O43731 214 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 CREB3O43889 395 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 CKMT2P17540 419 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 GKP32189 559 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 AIF1P55008 147 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 CAMK2BQ13554 666 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF805Q5CZA5 627 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 ACAD10Q6JQN1 1059 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 MCOLN2Q8IZK6 566 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 FAM174AQ8TBP5 190 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 TSC1Q92574 1164 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 RAB7BQ96AH8 199 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 SLC17A9Q9BYT1 436 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 DKK4Q9UBT3 224 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 FZD10Q9ULW2 581 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 MYO6Q9UM54 1294 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 LHX6Q9UPM6 363 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 C16orf96A6NNT2 1141 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 NEMP1O14524 444 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 TEX33O43247 280 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 TSPAN6O43657 245 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 BUB1O43683 1085 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 TMCC1O94876 653 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms