RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	CYP21A2	P08686	494 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	RALB	P11234	206 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	INSRR	P14616	1297 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SYN1	P17600	705 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	PFKL	P17858	780 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ATF6	P18850	670 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	S100A1	P23297	94 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	PSMB10	P40306	273 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SLC15A1	P46059	708 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CCR10	P46092	362 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	BAG6	P46379	1132 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CAPZA2	P47755	286 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	OAZ1	P54368	228 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	HERVK_113	P62684	666 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ERVK-24	P63145	666 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	AMPD2	Q01433	879 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	LGALS3BP	Q08380	585 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SLA	Q13239	276 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SPIDR	Q14159	915 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	GPR68	Q15743	365 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	BCL7A	Q4VC05	210 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	LCE2C	Q5TA81	110 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	FAM171B	Q6P995	826 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	USP37	Q86T82	979 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	KIF18B	Q86Y91	864 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CCNJL	Q8IV13	435 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	MB21D1	Q8N884	522 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	TRPV3	Q8NET8	790 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SEC14L1	Q92503	715 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	IRF7	Q92985	503 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	FAM162A	Q96A26	154 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ABHD8	Q96I13	439 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	FGD4	Q96M96	766 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	NEU1	Q99519	415 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	TPK1	Q9H3S4	243 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	POFUT1	Q9H488	388 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	INIP	Q9NRY2	104 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	COL20A1	Q9P218	1284 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	GGA2	Q9UJY4	613 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	USP21	Q9UK80	565 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	KIF27	Q86VH2	1401 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	OR14I1	A6ND48	311 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	MYO1F	O00160	1098 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	PLK4	O00444	970 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	TADA2A	O75478	443 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	GPX5	O75715	221 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	SERPINA3	P01011	423 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	IFNA14	P01570	189 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	ITGB3	P05106	788 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	MYZAP	P0CAP1	466 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	GNAT1	P11488	350 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC130	P13994	396 aa		3.28	□□□□□ -1.88

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