RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471202.5

CHTF18-208, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 2

Gene CHTF18, Length 4,494 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-208ENST00000471202 C9orf16Q9BUW7 83 aa14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 MGRN1O60291 552 aa14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 IL5RAQ01344 420 aa14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 SLC39A4Q6P5W5 647 aa14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 ARPINQ7Z6K5 226 aa14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 LRRC49Q8IUZ0 686 aa14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 RDH11Q8TC12 318 aa14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 PLEKHA8Q96JA3 519 aa14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 KLHL5Q96PQ7 755 aa14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 FZD8Q9H461 694 aa14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 ZNF180Q9UJW8 692 aa14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 VPS4BO75351 444 aa14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 MPSTP25325 297 aa14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 ASPAP45381 313 aa14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 CHN2P52757 468 aa14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 MTA1Q13330 715 aa14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 PDK3Q15120 406 aa14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 PTPRNQ16849 979 aa14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 TRIM60Q495X7 471 aa14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 EXOC2Q96KP1 924 aa14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 SLC4A5Q9BY07 1137 aa14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 DPEP3Q9H4B8 488 aa14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 CNTNAP1P78357 1384 aa14.65□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 GPD2P43304 727 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 TUFMP49411 452 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 KLF10Q13118 480 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 INSCQ1MX18 579 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 STXBP5Q5T5C0 1151 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 TMEM192Q8IY95 271 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 DNAJB14Q8TBM8 379 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 GLOD4Q9HC38 313 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 SLC25A13Q9UJS0 675 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 COL1A2P08123 1366 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 ZNF536O15090 1300 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 MMP3P08254 477 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 HGFP14210 728 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 IL1R2P27930 398 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 AIF1P55008 147 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 SQLEQ14534 574 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 SCIMPQ6UWF3 145 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 OTOP3Q7RTS5 596 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 BANPQ8N9N5 519 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 TBCDQ9BTW9 1192 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 SPAG4Q9NPE6 437 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 PAGE1O75459 146 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 RASSF9O75901 435 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 WDR47O94967 919 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 FGFR1P11362 822 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 CDC16Q13042 620 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 DDR2Q16832 855 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 ARMC12Q5T9G4 340 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 GLIS1Q8NBF1 620 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 GLMNQ92990 594 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 AAASQ9NRG9 546 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 HMGXB4Q9UGU5 601 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 VWA7Q9Y334 891 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 TRIM38O00635 465 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 MSI1O43347 362 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 TM7SF2O76062 418 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 POU1F1P28069 291 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 RAP1GDS1P52306 607 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 BCL2L1Q07817 233 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 AAGABQ6PD74 315 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 ITFG1Q8TB96 612 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 MAGEC3Q8TD91 643 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 SPATA16Q9BXB7 569 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 CLIC5Q9NZA1 410 aa14.64□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 CA9Q16790 459 aa14.63□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 CAMK1DQ8IU85 385 aa14.63□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 ZNF567Q8N184 647 aa14.63□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa14.63□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.63□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 OPTCQ9UBM4 332 aa14.63□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 BTRCQ9Y297 605 aa14.63□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 TREHO43280 583 aa14.63□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 PLIN3O60664 434 aa14.63□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 GCATO75600 419 aa14.63□□□□□ -0.07
CHTF18-208ENST00000471202 TCEA3O75764 348 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms