RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460278.5

ANKRD28-205, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-205ENST00000460278 GOLGA5Q8TBA6 731 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 OSCP1Q8WVF1 389 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 TEKT4Q8WW24 435 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 RAB40AQ8WXH6 277 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 SGCDQ92629 289 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 RNFT2Q96EX2 444 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 MCRS1Q96EZ8 462 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 AJUBAQ96IF1 538 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 EPSTI1Q96J88 318 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 LRIG1Q96JA1 1093 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 LOXL4Q96JB6 756 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 VPS50Q96JG6 964 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 CABS1Q96KC9 395 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 KLHL15Q96M94 604 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 ABHD1Q96SE0 405 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 RUFY1Q96T51 708 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 TCF25Q9BQ70 676 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC25A23Q9BV35 468 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 TLR10Q9BXR5 811 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 CLPBQ9H078 707 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 TNMDQ9H2S6 317 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 EPHX3Q9H6B9 360 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 LTB4R2Q9NPC1 389 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 TBC1D7Q9P0N9 293 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 ANAPC2Q9UJX6 822 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 RAB21Q9UL25 225 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 RIMKLBQ9ULI2 386 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC12A4Q9UP95 1085 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 PTPRGP23470 1445 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 BCORL1Q5H9F3 1711 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF536O15090 1300 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 CGNL1Q0VF96 1302 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 TRAV34A0A0B4J273 112 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 A0A1B0GUA9 196 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 TRBC2A0A5B9 178 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 ARHGEF37A1IGU5 675 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 LRRD1A4D1F6 860 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 A8MVJ9 347 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 H0YC42 278 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 GRM8O00222 908 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 PSMD9O00233 223 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 PER2O15055 1255 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 ASAP2O43150 1006 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 TRIAP1O43715 76 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 HBP1O60381 514 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 KERAO60938 352 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 SEC22BO75396 215 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 NDUFS3O75489 264 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 STAM2O75886 525 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 LMNAP02545 664 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 ITGB3P05106 788 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 TPOP07202 933 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 RPSAP08865 295 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 IRF1P10914 325 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 FCER1AP12319 257 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 ALADP13716 330 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 SELLP14151 372 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 PTPN2P17706 415 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 CHRM3P20309 590 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 GCSHP23434 173 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 HOXC8P31273 242 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 HSPA4P34932 840 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 HNF1BP35680 557 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 PBX1P40424 430 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 CD86P42081 329 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 GABRB2P47870 512 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 PSMD7P51665 324 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 MFAP4P55083 255 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 PSMC6P62333 389 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 ADAM8P78325 824 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 ARF5P84085 180 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 ARHGAP8P85298 464 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 IL1RL1Q01638 556 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 HGFACQ04756 655 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 CDK18Q07002 472 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 DDR1Q08345 913 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 ABHD18Q0P651 414 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 MTAPQ13126 283 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 CAMK2DQ13557 499 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 FHL3Q13643 280 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 ALCAMQ13740 583 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-205ENST00000460278 NFYCQ13952 458 aa3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms