RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 SCNN1BP51168 640 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 OCRLQ01968 901 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 ROR1Q01973 937 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF33AQ06730 810 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 TWF1Q12792 350 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 DRP2Q13474 957 aa6.66□□□□□ -1.34
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PTPRK-211ENST00000429595 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 SYCP2LQ5T4T6 812 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 AGAP9Q5VTM2 703 aa6.66□□□□□ -1.34
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PTPRK-211ENST00000429595 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 CD101Q93033 1021 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 RILPL2Q969X0 211 aa6.66□□□□□ -1.34
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PTPRK-211ENST00000429595 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 EMC7Q9NPA0 242 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 SNX14Q9Y5W7 946 aa6.66□□□□□ -1.34
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PTPRK-211ENST00000429595 TSC2P49815 1807 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 NOTCH4Q99466 2003 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 ABCA7Q8IZY2 2146 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 CFAP46Q8IYW2 2715 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 KALRNO60229 2985 aa6.65□□□□□ -1.34
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PTPRK-211ENST00000429595 H7C4K7 107 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 FLRT2O43155 660 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 TNFSF14O43557 240 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 MOSPD3O75425 235 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 ABLIM3O94929 683 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 FGF19O95750 216 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 THP07101 528 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 ITGAMP11215 1152 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 KRT10P13645 584 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 PDCP20941 246 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.341e-6■■□□□ 12.1
PTPRK-211ENST00000429595 SMARCA1P28370 1054 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 LGALS4P56470 323 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 IL2P60568 153 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 BLOC1S1P78537 153 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 PRKCEQ02156 737 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 PLD1Q13393 1074 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 TPGS2Q68CL5 300 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 DHRS13Q6UX07 377 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 NIPA1Q7RTP0 329 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 CATIPQ7Z7H3 387 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC33Q8N5R6 958 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 FRMD1Q8N878 549 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF248Q8NDW4 579 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 OLIG1Q8TAK6 271 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF480Q8WV37 535 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 LZTS2Q9BRK4 669 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 PAAF1Q9BRP4 392 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 EBF3Q9H4W6 596 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 CPNE5Q9HCH3 593 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 TM7SF3Q9NS93 570 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 CACNG4Q9UBN1 327 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 VWA8A3KMH1 1905 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 PTPRBP23467 1997 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 CREBBPQ92793 2442 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 NDUFS2O75306 463 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 GJB3O75712 270 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 CDKL5O76039 1030 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 B3GAT3O94766 335 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 SEC24AO95486 1093 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 CER1O95813 267 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 GASTP01350 101 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 PRKCBP05771 671 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 CRHR1P34998 444 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 MATKP42679 507 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ALDH1A3P47895 512 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 UBE2HP62256 183 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 BFSP1Q12934 665 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 TRDNQ13061 729 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 MPP3Q13368 585 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 PDCD1Q15116 288 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 SLC35G1Q2M3R5 365 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 XKR3Q5GH77 459 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 CT83Q5H943 113 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 WDR45BQ5MNZ6 344 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 SLC8B1Q6J4K2 584 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 IL27RAQ6UWB1 636 aa6.64□□□□□ -1.35
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