RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 SATB1Q01826 763 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1-201ENST00000357436 ANO4Q32M45 955 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1-201ENST00000357436 C11orf91Q3C1V1 193 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF111Q6ZNA4 994 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1-201ENST00000357436 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1-201ENST00000357436 DEFB107AQ8IZN7 70 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP2R3CQ969Q6 453 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1-201ENST00000357436 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1-201ENST00000357436 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC39A10Q9ULF5 831 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1-201ENST00000357436 PDE5AO76074 875 aa19.02■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 APOA4P06727 396 aa19.02■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 DNAJB2P25686 324 aa19.02■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 RAB27AP51159 221 aa19.02■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC5A3P53794 718 aa19.02■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF33AQ06730 810 aa19.02■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 PRPSAP1Q14558 356 aa19.02■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 NOMO2Q5JPE7 1267 aa19.02■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 OTOP3Q7RTS5 596 aa19.02■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 GALNT15Q8N3T1 639 aa19.02■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 PYDC1Q8WXC3 89 aa19.02■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 TSGA13Q96PP4 275 aa19.02■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 CYP4F11Q9HBI6 524 aa19.02■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa19.02■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC78A2IDD5 438 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 E9PBE3 544 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 KLHL41O60662 606 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 SBK3P0C264 359 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 PEX6Q13608 980 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 ZYG11AQ6WRX3 759 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 RDH11Q8TC12 318 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 IRGQQ8WZA9 623 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 OR52B2Q96RD2 323 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 SH3GL3Q99963 347 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 ACBD6Q9BR61 282 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR62Q9BZJ7 368 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM192AQ9GZU8 254 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 RHOJQ9H4E5 214 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 NMUR1Q9HB89 426 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 MID2Q9UJV3 735 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 MATN2O00339 956 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 PSMD3O43242 534 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 TBX18O95935 607 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 CALRP27797 417 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 RAPH1Q70E73 1250 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 DHDDSQ86SQ9 333 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 LINC00523Q86TU6 105 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 JADE3Q92613 823 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 RTKNQ9BST9 563 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 DRC3Q9H069 523 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 RGS18Q9NS28 235 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 POMPQ9Y244 141 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 XIRP2A4UGR9 3374 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 CHRNGP07510 517 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 USP46P62068 366 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 NKX3-2P78367 333 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 CUL3Q13618 768 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM171BQ6P995 826 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC8DQ7L1W4 858 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXW8Q8N3Y1 598 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 USP33Q8TEY7 942 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC28BQ9BUN5 200 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 TCF7L2Q9NQB0 619 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 OSER1Q9NX31 292 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 NEU3Q9UQ49 428 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 RAP2CQ9Y3L5 183 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 TK2O00142 265 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 TADA2AO75478 443 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 ZMPSTE24O75844 475 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 GABRB3P28472 473 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM171A1Q5VUB5 890 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 LIPMQ5VYY2 423 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM117BQ6P1L5 589 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 PDSS2Q86YH6 399 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 ZFAND2BQ8WV99 257 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 MOCOSQ96EN8 888 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 OSBPL2Q9H1P3 480 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 TASP1Q9H6P5 420 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 TLK1Q9UKI8 766 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 LCA5Q86VQ0 697 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 HPS6Q86YV9 775 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC26A7Q8TE54 656 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 M0QZQ0 153 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 CABYRO75952 493 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 AHSGP02765 367 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 MPSTP25325 297 aa18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms