RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
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GGPS1-201ENST00000282841 A0A0C4DFX4 3053 aa11.13□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 CNGA3Q16281 694 aa11.13□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 PPM1JQ5JR12 505 aa11.13□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 RABGAP1LQ5R372 815 aa11.13□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
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GGPS1-201ENST00000282841 SLC24A2Q9UI40 661 aa11.13□□□□□ -0.63
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GGPS1-201ENST00000282841 TCP10LQ8TDR4 215 aa11.12□□□□□ -0.63
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GGPS1-201ENST00000282841 MYLKQ15746 1914 aa11.12□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 ANKRD33BA6NCL7 494 aa11.12□□□□□ -0.63
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GGPS1-201ENST00000282841 PARP15Q460N3 678 aa11.12□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa11.12□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM25Q86YD3 366 aa11.12□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa11.12□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 NSMCE1Q8WV22 266 aa11.12□□□□□ -0.63
GGPS1-201ENST00000282841 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
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