RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264993.7

CDV3-201, Transcript of CDV3 homolog, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDV3, Length 3,307 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3-201ENST00000264993 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa20.36■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 ABCB10Q9NRK6 738 aa20.36■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 RIPK3Q9Y572 518 aa20.36■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 CYP3A5P20815 502 aa20.36■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 GABRB3P28472 473 aa20.36■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 IDUAP35475 653 aa20.36■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 CDH13P55290 713 aa20.36■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 GJA9P57773 515 aa20.36■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 TGFB2P61812 414 aa20.36■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 CYP51A1Q16850 503 aa20.36■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.36■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 IRGQQ8WZA9 623 aa20.36■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 ZNF597Q96LX8 424 aa20.36■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 BIRC8Q96P09 236 aa20.36■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 PDCD2LQ9BRP1 358 aa20.36■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 CNPY3Q9BT09 278 aa20.36■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 ELOVL4Q9GZR5 314 aa20.36■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 NOX1Q9Y5S8 564 aa20.36■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 MYL4P12829 197 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 SPRP35270 261 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 MERTKQ12866 999 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 ACDQ96AP0 544 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 TPK1Q9H3S4 243 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 PNPLA8Q9NP80 782 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 ATAD3AQ9NVI7 634 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 KLQ9UEF7 1012 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 LSM8O95777 96 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 ADORA2BP29275 332 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 JAK3P52333 1124 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 KRT76Q01546 638 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 VPS26BQ4G0F5 336 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 TIGD2Q4W5G0 525 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 REP15Q6BDI9 236 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 ACOT1Q86TX2 421 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 GLT1D1Q96MS3 346 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 IL12RB2Q99665 862 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 GIN1Q9NXP7 522 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 H0Y858 1186 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 AURKAO14965 403 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 SRP72O76094 671 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 TUFMP49411 452 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 OCA2Q04671 838 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 FAM214AQ32MH5 1076 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 BORAQ6PGQ7 559 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 HTR3CQ8WXA8 447 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 PPP1R14BQ96C90 147 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 NXNL1Q96CM4 212 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 FAM96AQ9H5X1 160 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 ZBTB26Q9HCK0 441 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 VPS45Q9NRW7 570 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 ANKEF1Q9NU02 776 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 MOCS1Q9NZB8 636 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 TSPAN16Q9UKR8 245 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 USP22Q9UPT9 525 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa20.35■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 CITO14578 2027 aa20.34■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 NR3C2P08235 984 aa20.34■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 RHDQ02161 417 aa20.34■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 PSMA8Q8TAA3 256 aa20.34■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 DLG3Q92796 817 aa20.34■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 GGA3Q9NZ52 723 aa20.34■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa20.34■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa20.34■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 AQP9O43315 295 aa20.34■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 CSHL1Q14406 222 aa20.34■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 HHIPL2Q6UWX4 724 aa20.34■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.34■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 RPS6KA2Q15349 733 aa20.33■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 CCDC14Q49A88 953 aa20.33■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 TMEM236Q5W0B7 351 aa20.33■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 DENND6AQ8IWF6 608 aa20.33■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 DDIASQ8IXT1 998 aa20.33■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 DHRSXQ8N5I4 330 aa20.33■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 CCDC185Q8N715 623 aa20.33■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 STARD8Q92502 1023 aa20.33■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 VPS39Q96JC1 886 aa20.33■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 TCF12Q99081 682 aa20.33■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa20.33■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 RAP2CQ9Y3L5 183 aa20.33■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa20.33■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 A8MV72 311 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 UBDO15205 165 aa20.33■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 NFICP08651 508 aa20.33■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 MMP10P09238 476 aa20.33■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 ZNF12P17014 697 aa20.33■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa20.33■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 SCIMPQ6UWF3 145 aa20.33■□□□□ 0.85
CDV3-201ENST00000264993 CLEC4FQ8N1N0 589 aa20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms