RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 ITCHQ96J02 903 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SENP8Q96LD8 212 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 WDR18Q9BV38 432 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CD248Q9HCU0 757 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SIK3Q9Y2K2 1263 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RWDD3Q9Y3V2 267 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RPTORQ8N122 1335 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PIPSLA2A3N6 862 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 E5RJQ4 531 aa7.29□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 FGF1P05230 155 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TTC23Q5W5X9 447 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ANKRD52Q8NB46 1076 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 STK32AQ8WU08 396 aa7.29□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 ELMO1Q92556 727 aa7.29□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 IL6P05231 212 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 USP17L7P0C7H9 530 aa7.29□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 AKAP5P24588 427 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 GABRB2P47870 512 aa7.29□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RAB10P61026 200 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 FAAP100Q0VG06 881 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 USP41Q3LFD5 358 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 DGKKQ5KSL6 1271 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TTC27Q6P3X3 843 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CCDC80Q76M96 950 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CKAP2Q8WWK9 683 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 BCL9LQ86UU0 1499 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ADRA1DP25100 572 aa7.29□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 SNX32Q86XE0 403 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 FAM71AQ8IYT1 594 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 S100ZQ8WXG8 99 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SPAG4Q9NPE6 437 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CYLDQ9NQC7 956 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa7.29□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 HGFP14210 728 aa7.28□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 CSNK2BP67870 215 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 LGALS3BPQ08380 585 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 DPYSQ14117 519 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 NOMO2Q5JPE7 1267 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 BROXQ5VW32 411 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 NEPROQ6NW34 567 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 AAGABQ6PD74 315 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 DEFB128Q7Z7B8 93 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CDH24Q86UP0 819 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 HDAC7Q8WUI4 952 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PHF21BQ96EK2 531 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CERS2Q96G23 380 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 OMDQ99983 421 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SEMA4AQ9H3S1 761 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 C3orf14Q9HBI5 128 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 HPS4Q9NQG7 708 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ARHGEF3Q9NR81 526 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ATP6V1HQ9UI12 483 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TFR2Q9UP52 801 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RAP2CQ9Y3L5 183 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 LYPLA2O95372 231 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 IDO1P14902 403 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 S100GP29377 79 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 IL12RB1P42701 662 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 LAPTM5Q13571 262 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 NR1D2Q14995 579 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 KLHL12Q53G59 568 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SPANXN2Q5MJ10 180 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CES5AQ6NT32 575 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 DSELQ8IZU8 1212 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CAMKK1Q8N5S9 505 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 LHX5Q9H2C1 402 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 FBXO10Q9UK96 956 aa7.28□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 FBXL21Q9UKT6 434 aa7.28□□□□□ -1.24
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