RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 CDH19Q9H159 772 aa16.76■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 DYRK4Q9NR20 520 aa16.76■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 FYNP06241 537 aa16.75■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 GCLMP48507 274 aa16.75■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 PPP3CAQ08209 521 aa16.75■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM164Q5U3C3 297 aa16.75■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 CEP57L1Q8IYX8 460 aa16.75■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 TTC39CQ8N584 583 aa16.75■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 IL22RA1Q8N6P7 574 aa16.75■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 DENND6BQ8NEG7 585 aa16.75■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 CLEC4CQ8WTT0 213 aa16.75■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 PAGE5Q96GU1 130 aa16.75■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa16.75■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 SLC13A1Q9BZW2 595 aa16.75■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 HS3ST2Q9Y278 367 aa16.75■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa16.75■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 OR51B4Q9Y5P0 310 aa16.75■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 RNF215Q9Y6U7 377 aa16.75■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 TCAF2A6NFQ2 919 aa16.74■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 DUX1O43812 170 aa16.74■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 VPS4BO75351 444 aa16.74■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 CLDN1O95832 211 aa16.74■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 PRNPP04156 253 aa16.74■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 SRCP12931 536 aa16.74■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 LVRNQ6Q4G3 990 aa16.74■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 CHST14Q8NCH0 376 aa16.74■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 UBA3Q8TBC4 463 aa16.74■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa16.74■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 FAXDC2Q96IV6 333 aa16.74■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 SLC45A3Q96JT2 553 aa16.74■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 FEM1AQ9BSK4 669 aa16.74■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 EXOC1Q9NV70 894 aa16.74■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 HESX1Q9UBX0 185 aa16.74■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 CFAP45Q9UL16 551 aa16.74■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 VPS4AQ9UN37 437 aa16.74■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 HPSEQ9Y251 543 aa16.74■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 FADS3Q9Y5Q0 445 aa16.74■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD36A6QL64 1941 aa16.74■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC168Q8NDH2 2452 aa16.74■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 DOCK4Q8N1I0 1966 aa16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 F5H5T6 163 aa16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 NKX2-8O15522 239 aa16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 MT-CO1P00395 513 aa16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM49P0CI25 452 aa16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM49CP0CI26 452 aa16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 SETSIPP0DME0 302 aa16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 CCL4P13236 92 aa16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 ADRB3P13945 408 aa16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 PFKFB1P16118 471 aa16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 NR1D1P20393 614 aa16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 UGT1A3P35503 534 aa16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 NEK3P51956 506 aa16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 THOP1P52888 689 aa16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 CDC20Q12834 499 aa16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 PTK2BQ14289 1009 aa16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 MACC1Q6ZN28 852 aa16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 TAC4Q86UU9 113 aa16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 OR6C4Q8NGE1 309 aa16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 RNF34Q969K3 372 aa16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 FEM1CQ96JP0 617 aa16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 APPL1Q9UKG1 709 aa16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1B0GVL5 298 aa16.72■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 PIK3R2O00459 728 aa16.72■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 AP1G1O43747 822 aa16.72■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 CNTN5O94779 1100 aa16.72■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 NR3C1P04150 777 aa16.72■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 RGS7P49802 495 aa16.72■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 VAMP7P51809 220 aa16.72■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 EFHC2Q5JST6 749 aa16.72■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 PHF19Q5T6S3 580 aa16.72■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 FAXCQ5TGI0 409 aa16.72■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 C1QL3Q5VWW1 255 aa16.72■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 PMF1Q6P1K2 205 aa16.72■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 SPRED1Q7Z699 444 aa16.72■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 ZSCAN30Q86W11 494 aa16.72■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC150Q8NCX0 1101 aa16.72■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R16AQ96I34 528 aa16.72■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC114Q96M63 670 aa16.72■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 SEMA6CQ9H3T2 930 aa16.72■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa16.72■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 WASF2Q9Y6W5 498 aa16.72■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 WIPF3A6NGB9 483 aa16.71■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 IGLON5A6NGN9 336 aa16.71■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 K7EM74 188 aa16.71■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 O00370 1275 aa16.71■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 PDXKO00764 312 aa16.71■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
SPCS1-201ENST00000233025 DDAH2O95865 285 aa16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms