RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 VSIG10LQ86VR7 867 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 ZIM3Q96PE6 472 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 PTPRJQ12913 1337 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 PIK3CDO00329 1044 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 KLHL18O94889 574 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 LYNP07948 512 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 ETS1P14921 441 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 TUSC3Q13454 348 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 TRPM4Q8TD43 1214 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 MCRS1Q96EZ8 462 aa10.66□□□□□ -0.7
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TRPS1-201ENST00000220888 ANGPT4Q9Y264 503 aa10.66□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 KRT75O95678 551 aa10.65□□□□□ -0.7
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TRPS1-201ENST00000220888 DDR1Q08345 913 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 COLEC12Q5KU26 742 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF605Q86T29 641 aa10.65□□□□□ -0.7
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TRPS1-201ENST00000220888 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 MCCC2Q9HCC0 563 aa10.65□□□□□ -0.7
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TRPS1-201ENST00000220888 KBTBD4Q9NVX7 518 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 FRMPD4Q14CM0 1322 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 A0A087X0B3 334 aa10.65□□□□□ -0.7
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TRPS1-201ENST00000220888 SLC24A5Q71RS6 500 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 SETD9Q8NE22 299 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 USP6NLQ92738 828 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 MAGEB18Q96M61 343 aa10.65□□□□□ -0.7
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TRPS1-201ENST00000220888 SEMA6BQ9H3T3 888 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 TAGLN3Q9UI15 199 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 PXDNLA1KZ92 1463 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.7
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TRPS1-201ENST00000220888 PRG2P13727 222 aa10.65□□□□□ -0.7
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TRPS1-201ENST00000220888 FOXM1Q08050 763 aa10.65□□□□□ -0.7
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TRPS1-201ENST00000220888 SF1Q15637 639 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
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TRPS1-201ENST00000220888 SEMA4DQ92854 862 aa10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 C3orf14Q9HBI5 128 aa10.65□□□□□ -0.7
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TRPS1-201ENST00000220888 WDR18Q9BV38 432 aa10.65□□□□□ -0.71
TRPS1-201ENST00000220888 DPEP2Q9H4A9 486 aa10.65□□□□□ -0.71
TRPS1-201ENST00000220888 REEP1Q9H902 201 aa10.65□□□□□ -0.71
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TRPS1-201ENST00000220888 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
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TRPS1-201ENST00000220888 GPR156Q8NFN8 814 aa10.64□□□□□ -0.71
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TRPS1-201ENST00000220888 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TRPS1-201ENST00000220888 RIBC2Q9H4K1 309 aa10.64□□□□□ -0.71
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TRPS1-201ENST00000220888 CCT8L1PA6NM43 557 aa10.64□□□□□ -0.71
TRPS1-201ENST00000220888 KCNH1O95259 989 aa10.64□□□□□ -0.71
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TRPS1-201ENST00000220888 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TRPS1-201ENST00000220888 NEK3P51956 506 aa10.64□□□□□ -0.71
TRPS1-201ENST00000220888 TAS2R50P59544 299 aa10.64□□□□□ -0.71
TRPS1-201ENST00000220888 CNGA2Q16280 664 aa10.64□□□□□ -0.71
TRPS1-201ENST00000220888 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa10.64□□□□□ -0.71
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TRPS1-201ENST00000220888 TTI2Q6NXR4 508 aa10.64□□□□□ -0.71
TRPS1-201ENST00000220888 CHST9Q7L1S5 443 aa10.64□□□□□ -0.71
TRPS1-201ENST00000220888 MON1AQ86VX9 555 aa10.64□□□□□ -0.71
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