RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000030117.4

Smu1-201, Transcript of WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Smu1, Length 2,418 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1-201ENSMUST00000030117 Scn10aQ6QIY3 1958 aa18.09■□□□□ 0.49
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ttll8A4Q9F1 832 aa18.09■□□□□ 0.49
Smu1-201ENSMUST00000030117 Krt4P07744 525 aa18.09■□□□□ 0.49
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cyp2f2P33267 491 aa18.09■□□□□ 0.49
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ctps2P70303 586 aa18.09■□□□□ 0.49
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cln3Q61124 438 aa18.09■□□□□ 0.49
Smu1-201ENSMUST00000030117 CochQ62507 552 aa18.09■□□□□ 0.49
Smu1-201ENSMUST00000030117 Hsfy2Q80Y37 392 aa18.09■□□□□ 0.49
Smu1-201ENSMUST00000030117 Fubp1Q91WJ8 651 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
Smu1-201ENSMUST00000030117 Aldh1b1Q9CZS1 519 aa18.09■□□□□ 0.49
Smu1-201ENSMUST00000030117 P2yr13Q9D8I2 337 aa18.09■□□□□ 0.49
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mettl7bQ9DD20 244 aa18.09■□□□□ 0.49
Smu1-201ENSMUST00000030117 BC024978J3QPC3 361 aa18.08■□□□□ 0.49
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gjd2O54851 321 aa18.08■□□□□ 0.49
Smu1-201ENSMUST00000030117 Chrna4O70174 629 aa18.08■□□□□ 0.49
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rab10P61027 200 aa18.08■□□□□ 0.49
Smu1-201ENSMUST00000030117 Adamts1P97857 968 aa18.08■□□□□ 0.49
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ankrd13bQ5F259 626 aa18.08■□□□□ 0.49
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ccdc90bQ8C3X2 256 aa18.08■□□□□ 0.49
Smu1-201ENSMUST00000030117 Nsl1Q8K305 281 aa18.08■□□□□ 0.49
Smu1-201ENSMUST00000030117 Pth2rQ91V95 546 aa18.08■□□□□ 0.49
Smu1-201ENSMUST00000030117 Sh3d19Q91X43 789 aa18.08■□□□□ 0.49
Smu1-201ENSMUST00000030117 Dok4Q99KE3 325 aa18.08■□□□□ 0.49
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ubxn2aQ99KJ0 258 aa18.08■□□□□ 0.49
Smu1-201ENSMUST00000030117 NvlQ9DBY8 855 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
Smu1-201ENSMUST00000030117 Trpc7Q9WVC5 862 aa18.08■□□□□ 0.49
Smu1-201ENSMUST00000030117 Usp51B1AY15 661 aa18.08■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Adamts14E9PX39 1209 aa18.08■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 XntrpcF8VQM8 1264 aa18.08■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Dnmt3aO88508 908 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Nfe2Q07279 373 aa18.08■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Fscn2Q32M02 492 aa18.08■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mfsd3Q5U419 412 aa18.08■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gpsm1Q6IR34 673 aa18.08■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 EmsyQ8BMB0 1264 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 TwnkQ8CIW5 685 aa18.08■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cyp4v2Q9DBW0 525 aa18.08■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Trim54Q9ERP3 366 aa18.08■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mmp19Q9JHI0 527 aa18.08■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Il17rbQ9JIP3 499 aa18.08■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Slamf1Q9QUM4 343 aa18.08■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Morf4l2Q9R0Q4 288 aa18.08■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rps6ka2Q9WUT3 733 aa18.08■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Kcnt2D3Z649 1135 aa18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Znf683I7HJS4 458 aa18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 P01740 135 aa18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Htr4P97288 388 aa18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Fbxw11Q5SRY7 542 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Hspa1aQ61696 641 aa18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Otud6aQ6IE21 290 aa18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 SvopQ8BFT9 548 aa18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gabra5Q8BHJ7 463 aa18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 DseQ8BLI4 958 aa18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Peli3Q8BXR6 445 aa18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tmem154Q8C4Q9 181 aa18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gfm2Q8R2Q4 779 aa18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Olfr1325Q8VF43 315 aa18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rgs10Q9CQE5 181 aa18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Hmgn3Q9DCB1 99 aa18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Btbd19S4R1I0 287 aa18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gm43302L7N1X8 611 aa18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 CenpaO35216 134 aa18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Casp2P29594 452 aa18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Il12bP43432 335 aa18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rpl36P47964 105 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 LmnaP48678 665 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gbp10Q000W5 611 aa18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Wdr36Q3TAQ9 899 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tmem102Q3UPR7 509 aa18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rbm44Q3V089 1013 aa18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Actr5Q80US4 605 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Sulf1Q8K007 870 aa18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tmprss4Q8VCA5 435 aa18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 DdoQ922Z0 341 aa18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Lrrc4Q99PH1 652 aa18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Zfp655Q9CZP3 541 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rhox9Q9EQM5 227 aa18.07■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mtx3D3YTP3 312 aa18.06■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Vmn2r14E9Q759 848 aa18.06■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Sbk3P0C5K0 361 aa18.06■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Lamp1P11438 406 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Treml2Q2LA85 329 aa18.06■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Suz12Q80U70 741 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Elmo2Q8BHL5 732 aa18.06■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 VcpkmtQ8C436 228 aa18.06■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Celf3Q8CIN6 465 aa18.06■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Zfp617Q91WM0 559 aa18.06■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Serpina3nQ91WP6 418 aa18.06■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 MydgfQ9CPT4 166 aa18.06■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Hormad1Q9D5T7 392 aa18.06■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Med20Q9R0X0 212 aa18.06■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Adam17Q9Z0F8 827 aa18.06■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rnf19bA2A7Q9 732 aa18.06■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ssxb8B1AY40 170 aa18.06■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Vmn2r74E9PW21 853 aa18.06■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Zbtb10E9Q8X5 861 aa18.06■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rhox2gL7MUB9 191 aa18.06■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Adam19O35674 920 aa18.06■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Psmd3P14685 530 aa18.06■□□□□ 0.48
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mmp3P28862 477 aa18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.9 ms