RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 DPF3Q92784 378 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 VPS45Q9NRW7 570 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 TBC1D23Q9NUY8 699 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF446Q9NWS9 450 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 COQ4Q9Y3A0 265 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MRASO14807 208 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 COL6A2P12110 1019 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SMPD1P17405 629 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ERCC2P18074 760 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 RPL3P39023 403 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 RUNX1T1Q06455 604 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 OLFML2BQ68BL8 750 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MFSD5Q6N075 450 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CES3Q6UWW8 571 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 C11orf96Q7Z7L8 435 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 C12orf29Q8N999 325 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CXorf40AQ8TE69 158 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 FZD8Q9H461 694 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SYBUQ9NX95 663 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 A0A088AWK7 358 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CLDN11O75508 207 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 KCNH1O95259 989 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 GUCA1CO95843 209 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SLURP2P0DP57 97 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ME2P23368 584 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CCNCP24863 283 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CXCR2P25025 360 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 RAD23AP54725 363 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CRY1Q16526 586 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 TBCELQ5QJ74 424 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 JOSD2Q8TAC2 188 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 METTL6Q8TCB7 284 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 OTULINQ96BN8 352 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CEP44Q9C0F1 390 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MSRAQ9UJ68 235 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 RAP2CQ9Y3L5 183 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PTPRJQ12913 1337 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MYH2Q9UKX2 1941 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SAC3D1A6NKF1 404 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGEF9O43307 516 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SNX3O60493 162 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SEC22BO75396 215 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 TGDSO95455 350 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ITGA2BP08514 1039 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 OCM2P0CE71 109 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 LBPP18428 481 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SERPINB3P29508 390 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 NUP107P57740 925 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SKP1P63208 163 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CDC16Q13042 620 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGAP17Q68EM7 881 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 UNC5AQ6ZN44 842 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 EID3Q8N140 333 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SUSD6Q92537 303 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SH3GL3Q99963 347 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM109Q9BVC6 243 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 GBA3Q9H227 469 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 TIAM2Q8IVF5 1701 aa6.54□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CLDN5O00501 218 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PAGE1O75459 146 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 GCATO75600 419 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 BAIAP3O94812 1187 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 C22orf31O95567 290 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 HDCP19113 662 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 LPOP22079 712 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SCNN1AP37088 669 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CDKN2BP42772 138 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 GLUD2P49448 558 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PURAQ00577 322 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM26Q6ZUK4 368 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SKA1Q96BD8 255 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 NSMCE2Q96MF7 247 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ADPRHL2Q9NX46 363 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.5 ms