RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615637.2

FOXD1-202, Transcript of forkhead box D1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene FOXD1, Length 2,272 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1-202ENST00000615637 ZNF597Q96LX8 424 aa30.96■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 ANLNQ9NQW6 1124 aa30.96■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 ADA2Q9NZK5 511 aa30.96■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 EPS15L1Q9UBC2 864 aa30.96■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 CIDEBQ9UHD4 219 aa30.96■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 H0YJX3 145 aa30.96■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 SDHDO14521 159 aa30.96■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 GABRB3P28472 473 aa30.96■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 PSMD8P48556 350 aa30.96■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 TSTD2Q5T7W7 516 aa30.96■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa30.96■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 DNAI2Q9GZS0 605 aa30.96■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 SNX25Q9H3E2 840 aa30.96■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 STAP1Q9ULZ2 295 aa30.96■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 RAD54BQ9Y620 910 aa30.96■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 CCDC78A2IDD5 438 aa30.95■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 KCNU1A8MYU2 1149 aa30.95■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 TRMUO75648 421 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 SLC25A27O95847 323 aa30.95■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 ZNF286BP0CG31 522 aa30.95■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 SEMA3BQ13214 749 aa30.95■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 GAB3Q8WWW8 586 aa30.95■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 GPR78Q96P69 363 aa30.95■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa30.95■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 THEGQ9P2T0 379 aa30.95■■■□□ 2.55
FOXD1-202ENST00000615637 I6L893 689 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 NDUFV1P49821 464 aa30.95■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 PSME3P61289 254 aa30.95■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 PELI3Q8N2H9 469 aa30.95■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 TSPAN14Q8NG11 270 aa30.95■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 COQ10BQ9H8M1 238 aa30.95■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 AP4S1Q9Y587 144 aa30.95■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 NUP205Q92621 2012 aa30.94■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 COL6A2P12110 1019 aa30.94■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 ADRA1BP35368 520 aa30.94■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 ZNF460Q14592 562 aa30.94■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 KCTD2Q14681 263 aa30.94■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 HFE2Q6ZVN8 426 aa30.94■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 SLC2A13Q96QE2 648 aa30.94■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa30.94■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 NCAM2O15394 837 aa30.94■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 AHSGP02765 367 aa30.94■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 CYTH1Q15438 398 aa30.94■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 NUP93Q8N1F7 819 aa30.94■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 CCNYL1Q8N7R7 359 aa30.94■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 UBP1Q9NZI7 540 aa30.94■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 TRHDEQ9UKU6 1024 aa30.94■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 COL1A2P08123 1366 aa30.93■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 BEST1O76090 585 aa30.93■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 PGK1P00558 417 aa30.93■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 ZNF23P17027 643 aa30.93■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 TPI1P60174 286 aa30.93■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 IKBKEQ14164 716 aa30.93■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa30.93■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 CARM1Q86X55 608 aa30.93■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 KIFC1Q9BW19 673 aa30.93■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 PCDHAC1Q9H158 963 aa30.93■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 GMEB1Q9Y692 573 aa30.93■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 E7ENX8 843 aa30.93■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 PIRO00625 290 aa30.93■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 DGKDQ16760 1214 aa30.93■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 Q3C1V9 767 aa30.93■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 ALKAL1Q6UXT8 129 aa30.93■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 HMGCLL1Q8TB92 370 aa30.93■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 LRTOMTQ8WZ04 291 aa30.93■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 HDAC11Q96DB2 347 aa30.93■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 HAUS8Q9BT25 410 aa30.93■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 DUSP16Q9BY84 665 aa30.93■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 ACOT9Q9Y305 439 aa30.93■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 A0A0J9YVX5 310 aa30.92■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 TRPC5OSA6NMA1 111 aa30.92■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 DNAJB1P25685 340 aa30.92■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 EMP3P54852 163 aa30.92■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 CEP97Q8IW35 865 aa30.92■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 MFSD6LQ8IWD5 586 aa30.92■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 CEP70Q8NHQ1 597 aa30.92■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 NXNL1Q96CM4 212 aa30.92■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 BPTFQ12830 3046 aa30.92■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 ARHGEF37A1IGU5 675 aa30.91■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 MTSS1O43312 755 aa30.91■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 NPHS1O60500 1241 aa30.91■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 CSPG5O95196 566 aa30.91■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 CDH17Q12864 832 aa30.91■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 SLC27A1Q6PCB7 646 aa30.91■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa30.91■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 SPATA6LQ8N4H0 392 aa30.91■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 TOP1MTQ969P6 601 aa30.91■■■□□ 2.54
FOXD1-202ENST00000615637 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.4 ms