RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591107.6

NPC1-212, Transcript of NPC intracellular cholesterol transporter 1, human

TSL 3

Gene NPC1, Length 890 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPC1-212	ENST00000591107		A0A1W2PQU0	124 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	BRINP1	O60477	761 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	GYPC	P04921	128 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	THEGL	P0DJG4	465 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	PON1	P27169	355 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	PLK1	P53350	603 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	SULT2A1	Q06520	285 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	TRIM14	Q14142	442 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	MEA1	Q16626	185 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	RAB6C	Q53S08	254 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	TAF3	Q5VWG9	929 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	TRIM69	Q86WT6	500 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	OR13H1	Q8NG92	308 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	OR7D4	Q8NG98	312 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	TBCB	Q99426	244 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	SYNC	Q9H7C4	482 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	MCF2L	O15068	1137 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	EPHB6	O15197	1021 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	YKT6	O15498	198 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	TPM1	P09493	284 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	CASP14	P31944	242 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	RXRG	P48443	463 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	SLC12A1	Q13621	1099 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	STAT4	Q14765	748 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	FIGN	Q5HY92	759 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	TRNP1	Q6NT89	227 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	SLC25A45	Q8N413	288 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	WNT2B	Q93097	391 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	GAN	Q9H2C0	597 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	SLC7A4	O43246	635 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	C1QL1	O75973	258 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	NEBL	O76041	1014 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	SLC2A3	P11169	496 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	CKMT2	P17540	419 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	CHRNA3	P32297	505 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	GSDMD	P57764	484 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	DAB2	P98082	770 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	SLC6A3	Q01959	620 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	ARTN	Q5T4W7	220 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	IQCD	Q96DY2	449 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	NPY6R	Q99463	290 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	GGT7	Q9UJ14	662 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	DMTF1	Q9Y222	760 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		13.52	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		13.52	□□□□□ -0.24
NPC1-212	ENST00000591107		A0A1W2PQJ5	194 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NPC1-212	ENST00000591107	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
NPC1-212	ENST00000591107	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NPC1-212	ENST00000591107	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
NPC1-212	ENST00000591107	RAD51B	O15315	384 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NPC1-212	ENST00000591107	MFAP3L	O75121	409 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NPC1-212	ENST00000591107	CLDN11	O75508	207 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NPC1-212	ENST00000591107	PCDH8	O95206	1070 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NPC1-212	ENST00000591107	GLI1	P08151	1106 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NPC1-212	ENST00000591107	DGKA	P23743	735 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NPC1-212	ENST00000591107	GK	P32189	559 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NPC1-212	ENST00000591107	FLT3	P36888	993 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NPC1-212	ENST00000591107	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
NPC1-212	ENST00000591107	CDH4	P55283	916 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NPC1-212	ENST00000591107	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
NPC1-212	ENST00000591107	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NPC1-212	ENST00000591107	FGL2	Q14314	439 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NPC1-212	ENST00000591107	ZNF284	Q2VY69	593 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NPC1-212	ENST00000591107	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NPC1-212	ENST00000591107	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
NPC1-212	ENST00000591107	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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