RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589104.5

KDM4B-208, Transcript of lysine demethylase 4B, human

TSL 2

Gene KDM4B, Length 3,470 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KDM4B-208	ENST00000589104	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	SNX16	P57768	344 aa		13.62	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	FSCB	Q5H9T9	825 aa		13.62	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		13.62	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		13.62	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	TEKT5	Q96M29	485 aa		13.62	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		13.62	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		13.62	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		13.62	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	TIMM44	O43615	452 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	INHBB	P09529	407 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	IGBP1	P78318	339 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	CTBS	Q01459	385 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	MED21	Q13503	144 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	RASSF3	Q86WH2	238 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	PKP2	Q99959	881 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	OLAH	Q9NV23	265 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104		A6NJR5	290 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	DCX	O43602	365 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	DLX3	O60479	287 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	MAP3K6	O95382	1288 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	SLC5A2	P31639	672 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	ADRM1	Q16186	407 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	C16orf89	Q6UX73	402 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	CDKL2	Q92772	493 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	BIRC8	Q96P09	236 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	DMTF1	Q9Y222	760 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	PIK3R2	O00459	728 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	KRT19	P08727	400 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	MPST	P25325	297 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	SUOX	P51687	545 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	ACVR1	Q04771	509 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	SPATS1	Q496A3	300 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104		A0A096LPK6	155 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	WASH4P	A8MWX3	477 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	MAGEB3	O15480	346 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	PRR35	P0CG20	571 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	ZNF24	P17028	368 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	AXL	P30530	894 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	ADRA1B	P35368	520 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	PPIL2	Q13356	520 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	DLG2	Q15700	870 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	PSMD5	Q16401	504 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	CEP97	Q8IW35	865 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	DEFB106A	Q8N104	65 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	NLRP7	Q8WX94	980 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	TCHP	Q9BT92	498 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	CAPN8	A6NHC0	703 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	TMCC1	O94876	653 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	PGK2	P07205	417 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	BMP2	P12643	396 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	ZNF23	P17027	643 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	TFEB	P19484	476 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	MLH1	P40692	756 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	GJA8	P48165	433 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	HSPA13	P48723	471 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	TUBA4A	P68366	448 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	ANO4	Q32M45	955 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	NADK2	Q4G0N4	442 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	CFAP157	Q5JU67	520 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	TNS4	Q8IZW8	715 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	GPC2	Q8N158	579 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	WNT8B	Q93098	351 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	VPS39	Q96JC1	886 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		13.6	□□□□□ -0.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms