RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581080.1

RARA-AS1-201, RARA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARA-AS1, Length 1,790 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARA-AS1-201ENST00000581080 KCNA5P22460 613 aa23.76■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 GRIA1P42261 906 aa23.76■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 CBLBQ13191 982 aa23.76■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 CYTH1Q15438 398 aa23.76■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF534Q76KX8 674 aa23.76■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 YAF2Q8IY57 180 aa23.76■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 MGME1Q9BQP7 344 aa23.76■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 SEMA4AQ9H3S1 761 aa23.76■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 HPS4Q9NQG7 708 aa23.76■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 E7ESA3 106 aa23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 PSMD3O43242 534 aa23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 GRM2Q14416 872 aa23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 FUT11Q495W5 492 aa23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 MSS51Q4VC12 460 aa23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 ALG1LQ6GMV1 187 aa23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 MTSS1LQ765P7 747 aa23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 ARRDC2Q8TBH0 407 aa23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 GRXCR2A6NFK2 248 aa23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 ALOX15BO15296 676 aa23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 AVILO75366 819 aa23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 MT-CO1P00395 513 aa23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 MLNP12872 115 aa23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 GEMP55040 296 aa23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 NIPAL4Q0D2K0 466 aa23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 SPARCL1Q14515 664 aa23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 DMC1Q14565 340 aa23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 SPDYCQ5MJ68 293 aa23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 LRRC40Q9H9A6 602 aa23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 SAYSD1Q9NPB0 183 aa23.75■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 MAP2K7O14733 419 aa23.74■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 TMCC1O94876 653 aa23.74■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 HSD17B3P37058 310 aa23.74■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 MAGEA3P43357 314 aa23.74■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 MAGEA4P43358 317 aa23.74■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 DSC2Q02487 901 aa23.74■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC20A2Q08357 652 aa23.74■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 MTM1Q13496 603 aa23.74■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 LRRC8BQ6P9F7 803 aa23.74■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 ADIPOR2Q86V24 386 aa23.74■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa23.74■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 SEMA3CQ99985 751 aa23.74■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 VPS45Q9NRW7 570 aa23.74■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRIM24O15164 1050 aa23.73■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 ATP8B1O43520 1251 aa23.73■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 MMP2P08253 660 aa23.73■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 CISD3P0C7P0 127 aa23.73■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 MPP3Q13368 585 aa23.73■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 RUNX3Q13761 415 aa23.73■■□□□ 1.39
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RARA-AS1-201ENST00000581080 GAB4Q2WGN9 574 aa23.73■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 C12orf40Q86WS4 652 aa23.73■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZBED8Q8IZ13 594 aa23.73■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 AHI1Q8N157 1196 aa23.73■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
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RARA-AS1-201ENST00000581080 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 ANHXE9PGG2 379 aa23.73■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 TULP3O75386 442 aa23.73■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 SASH3O75995 380 aa23.73■■□□□ 1.39
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RARA-AS1-201ENST00000581080 CD86P42081 329 aa23.73■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 DGKGP49619 791 aa23.73■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 SULT2A1Q06520 285 aa23.73■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 NR1H3Q13133 447 aa23.73■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 BBS9Q3SYG4 887 aa23.73■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa23.73■■□□□ 1.39
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RARA-AS1-201ENST00000581080 CPA6Q8N4T0 437 aa23.73■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 EPB41L4BQ9H329 900 aa23.73■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa23.73■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 NUMBLQ9Y6R0 609 aa23.73■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 MBTPS2O43462 519 aa23.72■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 USP12O75317 370 aa23.72■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 BANF1O75531 89 aa23.72■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 CR2P20023 1033 aa23.72■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 GDI1P31150 447 aa23.72■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP23.72■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 OLIG2Q13516 323 aa23.72■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 IHHQ14623 411 aa23.72■■□□□ 1.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
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