RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 PRELID2Q8N945 189 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 HAS1Q92839 578 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 CBFA2T3O75081 653 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 EPHX2P34913 555 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 GTF2BQ00403 316 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 ZFPM1Q8IX07 1006 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 BAP1Q92560 729 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 LRMDAQ9H2I8 198 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 RNF19AQ9NV58 838 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 ATXN10Q9UBB4 475 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 CD86P42081 329 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 KLQ9UEF7 1012 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 KRT36O76013 467 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 ACADMP11310 421 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 ADORA2AP29274 412 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 DUPD1Q68J44 220 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 STK40Q8N2I9 435 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM86AQ8N2M4 240 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 STAG3L4Q8TBR4 150 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 MORF4L1Q9UBU8 362 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 FMO1Q01740 532 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 STX4Q12846 297 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 DGCR6Q14129 220 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 GSTA3Q16772 222 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 CYP20A1Q6UW02 462 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 AP3M1Q9Y2T2 418 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 PGM3O95394 542 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 ANPEPP15144 967 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 PDK3Q15120 406 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 PWWP2AQ96N64 755 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 VPS45Q9NRW7 570 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 VAV1P15498 845 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 TSHRP16473 764 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 ITGA1P56199 1179 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 TTC7BQ86TV6 843 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 PSEN2P49810 448 aa21.58■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF662Q6ZS27 426 aa21.58■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 FBXW8Q8N3Y1 598 aa21.58■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 TSPAN14Q8NG11 270 aa21.58■■□□□ 1.04
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PTPRM-211ENST00000580170 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
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PTPRM-211ENST00000580170 RNF157Q96PX1 679 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 SPG21Q9NZD8 308 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 BMP10O95393 424 aa21.57■■□□□ 1.04
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PTPRM-211ENST00000580170 IFNGR2P38484 337 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 TEKT5Q96M29 485 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 EHD3Q9NZN3 535 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 NUDT17P0C025 328 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 ACSM2AQ08AH3 577 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 EML3Q32P44 896 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 ACSM2BQ68CK6 577 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 CDC73Q6P1J9 531 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 ATG14Q6ZNE5 492 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 SENP8Q96LD8 212 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 IDI2Q9BXS1 227 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa21.57■■□□□ 1.04
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PTPRM-211ENST00000580170 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa21.57■■□□□ 1.04
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PTPRM-211ENST00000580170 BST1Q10588 318 aa21.57■■□□□ 1.04
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 TRPV2Q9Y5S1 764 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 NFKB1P19838 968 aa21.57■■□□□ 1.04
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PTPRM-211ENST00000580170 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 DHDDSQ86SQ9 333 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 UNC93AQ86WB7 457 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 EFCAB3Q8N7B9 438 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM216Q9P0N5 145 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 PEX11AO75192 247 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 ENTPD5O75356 428 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 CDH3P22223 829 aa21.56■■□□□ 1.04
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