RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	IL12RB2	Q99665	862 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	GLOD4	Q9HC38	313 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	MRGBP	Q9NV56	204 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC189	A1A4V9	331 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	TARM1	B6A8C7	271 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	ZMPSTE24	O75844	475 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	SBK3	P0C264	359 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	UQCRB	P14927	111 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	PPP2R5D	Q14738	602 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	FAM171B	Q6P995	826 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	ARL5C	A6NH57	179 aa		18.66	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		18.66	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	AIM2	O14862	343 aa		18.66	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	MATN3	O15232	486 aa		18.66	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV3-25	P01717	112 aa		18.66	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	FKBP1B	P68106	108 aa		18.66	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	BEX3	Q00994	111 aa		18.66	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	PEX6	Q13608	980 aa		18.66	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	TRIP10	Q15642	601 aa		18.66	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		18.66	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	18.66	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	SNX32	Q86XE0	403 aa		18.66	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		18.66	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	USP33	Q8TEY7	942 aa		18.66	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	BTBD9	Q96Q07	612 aa		18.66	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	EBF3	Q9H4W6	596 aa		18.66	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		18.66	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	ENO4	A6NNW6	628 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	NEMP1	O14524	444 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	GRID2	O43424	1007 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	NPHS1	O60500	1241 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	VAPB	O95292	243 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	GABRB3	P28472	473 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	EPHA3	P29320	983 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	HOXC13	P31276	330 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	ITGA7	Q13683	1181 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	POU6F1	Q14863	301 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	UPP1	Q16831	310 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	IPMK	Q8NFU5	416 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	DSE	Q9UL01	958 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559		A0A087X1B8	175 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	TADA2A	O75478	443 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	PAX3	P23760	479 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	GLRB	P48167	497 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	HIPK4	Q8NE63	616 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	NUF2	Q9BZD4	464 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	SIK2	Q9H0K1	926 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	XPR1	Q9UBH6	696 aa		18.65	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		18.65	■□□□□ 0.58

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