RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550155.5

CNOT2-222, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2

Gene CNOT2, Length 842 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-222	ENST00000550155	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	CUZD1	Q86UP6	607 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	TEX45	Q8NA69	505 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	NCSTN	Q92542	709 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	LHPP	Q9H008	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155		A0A0A0MQY5	61 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	PLSCR5	A0PG75	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	CAMTA2	O94983	1202 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	SOX30	O94993	753 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	PDLIM4	P50479	330 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	ARHGAP8	P85298	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	SMTNL1	A8MU46	457 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	HBP1	O60381	514 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	CLDN7	O95471	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	CKMT1A	P12532	417 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	ARSA	P15289	507 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	COASY	Q13057	564 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	RBFA	Q8N0V3	343 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	POF1B	Q8WVV4	589 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	LINC01553	A4QN01	128 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	SLC16A5	O15375	505 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	ZNF432	O94892	652 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	DAO	P14920	347 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	PEX5	P50542	639 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	MVD	P53602	400 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	TUBA1B	P68363	451 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	TIGD6	Q17RP2	521 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	TRIM73	Q86UV7	250 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT2-222	ENST00000550155		A0A1B0GUV1	79 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155		A0A1B0GVM2	712 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	CHL1	O00533	1208 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	PPP1R3D	O95685	299 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	ZNF12	P17014	697 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	ITGB8	P26012	769 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	GJC1	P36383	396 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	DCAF6	Q58WW2	860 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	IGSF21	Q96ID5	467 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	MTNR1A	P48039	350 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	TRIM14	Q14142	442 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	GHDC	Q8N2G8	530 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CNOT2-222	ENST00000550155	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64

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