RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545180.5

SPHK1-203, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SPHK1, Length 2,238 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-203ENST00000545180 GSC2O15499 205 aa20.49■□□□□ 0.87
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SPHK1-203ENST00000545180 EZRP15311 586 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
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SPHK1-203ENST00000545180 WNT3AP56704 352 aa20.49■□□□□ 0.87
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SPHK1-203ENST00000545180 IGSF8Q969P0 613 aa20.49■□□□□ 0.87
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SPHK1-203ENST00000545180 MARC1Q5VT66 337 aa20.48■□□□□ 0.87
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SPHK1-203ENST00000545180 RAPH1Q70E73 1250 aa20.48■□□□□ 0.87
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SPHK1-203ENST00000545180 PNPOQ9NVS9 261 aa20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-203ENST00000545180 SLC12A8A0AV02 714 aa20.47■□□□□ 0.87
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SPHK1-203ENST00000545180 SLC10A7Q0GE19 358 aa20.47■□□□□ 0.87
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SPHK1-203ENST00000545180 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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SPHK1-203ENST00000545180 EBF2Q9HAK2 575 aa20.47■□□□□ 0.87
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SPHK1-203ENST00000545180 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa20.47■□□□□ 0.87
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SPHK1-203ENST00000545180 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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SPHK1-203ENST00000545180 SAT1P21673 171 aa20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-203ENST00000545180 POLD2P49005 469 aa20.46■□□□□ 0.87
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SPHK1-203ENST00000545180 ARMC3Q5W041 872 aa20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-203ENST00000545180 NAPRTQ6XQN6 538 aa20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-203ENST00000545180 MAVSQ7Z434 540 aa20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-203ENST00000545180 LCA5Q86VQ0 697 aa20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-203ENST00000545180 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-203ENST00000545180 PSMG2Q969U7 264 aa20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-203ENST00000545180 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-203ENST00000545180 VPS45Q9NRW7 570 aa20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-203ENST00000545180 DNAJC28Q9NX36 388 aa20.46■□□□□ 0.87
SPHK1-203ENST00000545180 MID2Q9UJV3 735 aa20.46■□□□□ 0.87
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