RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516443.1

RNU6-687P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 687, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-687P, Length 89 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-687P-201ENST00000516443 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 MSI1O43347 362 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 RGS10O43665 173 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 GPRIN2O60269 458 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 SRGAP2O75044 1071 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 AHSGP02765 367 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 IGKV4-1P06312 121 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 VDRP11473 427 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 HNF4AP41235 474 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 ADCYAP1R1P41586 468 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 AGTR2P50052 363 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 GATMP50440 423 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 SNX16P57768 344 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 BRWD1-AS2P59051 145 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 PPARDQ03181 441 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 OLIG2Q13516 323 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 C3AR1Q16581 482 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 AMZ1Q400G9 498 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 PLA1AQ53H76 456 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 PLD3Q8IV08 490 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 SCML4Q8N228 414 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 DPP10Q8N608 796 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 CD177Q8N6Q3 437 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 MRGPRDQ8TDS7 321 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 KAT5Q92993 513 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 LRRC1Q9BTT6 524 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 KLHL1Q9NR64 748 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 DNAJC28Q9NX36 388 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 STEAP1Q9UHE8 339 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 IL17BQ9UHF5 180 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 TMX2Q9Y320 296 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 MSRB2Q9Y3D2 182 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 RAP2CQ9Y3L5 183 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 MYO1CO00159 1063 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 RASA4O43374 803 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 GAGE7O76087 117 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 RFPL3SP0C7P2 107 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 FTH1P19P0C7X4 201 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 GAGE12FP0CL80 117 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 GAGE12GP0CL81 117 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 GAGE12IP0CL82 117 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 FOLR2P14207 255 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 ERCC3P19447 782 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 PIK3R1P27986 724 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 CYP4A11Q02928 519 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 RELQ04864 619 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 GAGE1Q13065 139 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 GAGE4Q13068 117 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 CLUL1Q15846 466 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 TFDP3Q5H9I0 405 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 FAM69BQ5VUD6 431 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 OLFML2AQ68BL7 652 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 PPP4R3AQ6IN85 833 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 AAGABQ6PD74 315 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 TFAP2EQ6VUC0 442 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 C14orf80Q86SX3 495 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 YAF2Q8IY57 180 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 SUMF1Q8NBK3 374 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 C17orf47Q8NEP4 570 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 TMEM163Q8TC26 289 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 FCAMRQ8WWV6 532 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 ASB12Q8WXK4 309 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 STARD4Q96DR4 205 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 ZNF333Q96JL9 665 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 GPR78Q96P69 363 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 TRIM5Q9C035 493 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 CSTL1Q9H114 145 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 ZSCAN32Q9NX65 697 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 LRWD1Q9UFC0 647 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 SERPINE3A8MV23 424 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 FAM227AF5H4B4 570 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 AGPSO00116 658 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 RASAL1O95294 804 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-687P-201ENST00000516443 TMEM225BP0DP42 221 aa-0.44□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms