RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486357.1

APOBEC3G-206, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 4

Gene APOBEC3G, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-206ENST00000486357 PCSK1P29120 753 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 WASP42768 502 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 RENBPP51606 427 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 LGALS4P56470 323 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF33AQ06730 810 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 ST3GAL1Q11201 340 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 ANO4Q32M45 955 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 SPDYCQ5MJ68 293 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC36A4Q6YBV0 504 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 C4orf50Q6ZRC1 276 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 GPR155Q7Z3F1 870 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 RABEPKQ7Z6M1 372 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 SFTPA1Q8IWL2 248 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM86AQ8N2M4 240 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 OLIG1Q8TAK6 271 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 ERLEC1Q96DZ1 483 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 CALML4Q96GE6 196 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 LRIG1Q96JA1 1093 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 CAMK1GQ96NX5 476 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCSER1Q9C0I3 900 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 SMPD4Q9NXE4 827 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 GCNT4Q9P109 453 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 SNX9Q9Y5X1 595 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 FASNP49327 2511 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 IGF2RP11717 2491 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 CEP295Q9C0D2 2601 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 CAPN8A6NHC0 703 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 GOLGA6L22H0YM25 854 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 IL18RAPO95256 599 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 NTRK1P04629 796 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 ITGB3P05106 788 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 CELA3BP08861 270 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 MSL3P1P0C860 447 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 ABCD1P33897 745 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 HOXD12P35452 270 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 UBA7P41226 1012 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 LHX1P48742 406 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 CASP5P51878 434 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC16A1P53985 500 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 TRIM14Q14142 442 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 POSTNQ15063 836 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCDC142Q17RM4 750 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 HYIQ5T013 277 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC39A4Q6P5W5 647 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 PCGF5Q86SE9 256 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 ADGRF2Q8IZF7 708 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 PAF1Q8N7H5 531 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 LRTOMTQ8WZ04 291 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM213AQ9BRX8 229 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 NUP62CLQ9H1M0 184 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 CFAP97Q9P2B7 532 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 RAXQ9Y2V3 346 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 CPQQ9Y646 472 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 EML5Q05BV3 1969 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 FRYQ5TBA9 3013 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 PRAMEF25A6NGN4 478 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 HGSO14964 777 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 HCRTO43612 131 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 ATP2C2O75185 946 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 PRLP01236 227 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 CD59P13987 128 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 HOXB2P14652 356 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 GNSP15586 552 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 TNFRSF4P43489 277 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 RBP5P82980 135 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 GTF2BQ00403 316 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 MVKQ03426 396 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 MESP2Q0VG99 397 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 MYO1EQ12965 1108 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 CFAP221Q4G0U5 840 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM119Q4V9L6 283 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCDC70Q6NSX1 233 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF354CQ86Y25 554 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3G-206ENST00000486357 SYCP3Q8IZU3 236 aa7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms